RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 GRIK1P39086 918 aa8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 IFNAR2P48551 515 aa8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 PXNP49023 591 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 NASPP49321 788 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 PDE6CP51160 858 aa8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 MTF1Q14872 753 aa8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 SCARA3Q6AZY7 606 aa8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 VSTM1Q6UX27 236 aa8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 PRR23CQ6ZRP0 262 aa8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 OSTM1Q86WC4 334 aa8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 IQUBQ8NA54 791 aa8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 RDH13Q8NBN7 331 aa8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 LINC00301Q8NCQ3 95 aa8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 STKLD1Q8NE28 680 aa8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 OR5B17Q8NGF7 314 aa8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 OSCP1Q8WVF1 389 aa8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 GAB3Q8WWW8 586 aa8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 ATP2A3Q93084 1043 aa8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 LOXL4Q96JB6 756 aa8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 FAM84AQ96KN4 292 aa8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 CEP295NLQ96MC4 621 aa8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 FNBP1Q96RU3 617 aa8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 SYT15Q9BQS2 421 aa8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 TNMDQ9H2S6 317 aa8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 SNX25Q9H3E2 840 aa8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 ECT2Q9H8V3 914 aa8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 HSPBP1Q9NZL4 362 aa8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 EHD2Q9NZN4 543 aa8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 CDH9Q9ULB4 789 aa8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 MTMR6Q9Y217 621 aa8.73□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 MYH11P35749 1972 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 FANCMQ8IYD8 2048 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 C2orf78A6NCI8 922 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 HCRTO43612 131 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 RNF40O75150 1001 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 PPP6R2O75170 966 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 ATP2C2O75185 946 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 EGFP01133 1207 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 CKMP06732 381 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 DLATP10515 647 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 TNNI1P19237 187 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 WARSP23381 471 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 BDNFP23560 247 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 LMO2P25791 158 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 GJA4P35212 333 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 PPP3CCP48454 512 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 ASIC1P78348 528 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 CYP27A1Q02318 531 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 PSMD2Q13200 908 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 KCNB1Q14721 858 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 LIMS2Q7Z4I7 341 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 CBWD2Q8IUF1 395 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 WDR49Q8IV35 697 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 ZNF507Q8TCN5 953 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 CD101Q93033 1021 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 CCDC127Q96BQ5 260 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 CHFRQ96EP1 664 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 SPATA17Q96L03 361 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 SLC22A12Q96S37 553 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 TRIM9Q9C026 710 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 LINC00597Q9H2U6 94 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 KBTBD4Q9NVX7 518 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 GCNT4Q9P109 453 aa8.72□□□□□ -1.01
COCH-211ENST00000557065 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 TRIM66O15016 1216 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 GDF9O60383 454 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 CUTAO60888 179 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 TACC1O75410 805 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 AKAP3O75969 853 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 CST3P01034 146 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 ZNF806P0C7X5 589 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 PFKLP17858 780 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 HOXC13P31276 330 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 HOXD13P35453 343 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 RAP1GAPP47736 663 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 TNNC1P63316 161 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 TRPC3Q13507 836 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 ZNF77Q15935 545 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 CCDC142Q17RM4 750 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 EML3Q32P44 896 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 WDR72Q3MJ13 1102 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 FAM26FQ5R3K3 315 aa8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
COCH-211ENST00000557065 IL31Q6EBC2 164 aa8.71□□□□□ -1.02
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