RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548746.5

CS-213, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-213ENST00000548746 MTSS1LQ765P7 747 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 TMEM150AQ86TG1 271 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 FAM35AQ86V20 835 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 FUKQ8N0W3 1084 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 ITFG1Q8TB96 612 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 SHKBP1Q8TBC3 707 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 TCEAL4Q96EI5 215 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 SMARCD1Q96GM5 515 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 FAM81BQ96LP2 452 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 ARID3AQ99856 593 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 CORO1BQ9BR76 489 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 GPR88Q9GZN0 384 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 HSD3B7Q9H2F3 369 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 MMRN2Q9H8L6 949 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 PNPLA8Q9NP80 782 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 CISHQ9NSE2 258 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 IL37Q9NZH6 218 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 MYO16Q9Y6X6 1858 aa6.29□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 ATP8B3O60423 1300 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 TRIOO75962 3097 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 LRRC10BA6NIK2 292 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 SLC38A8A6NNN8 435 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 KCNJ18B7U540 433 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 TNFRSF10BO14763 440 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 ECI2O75521 394 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 OLFM2O95897 454 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 F11P03951 625 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 PAEPP09466 180 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 ALADP13716 330 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 PFKLP17858 780 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 BDNFP23560 247 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 FCARP24071 287 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 PPP3CCP48454 512 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 GPR15P49685 360 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 CACNA2D1P54289 1103 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 RAD23BP54727 409 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 MYL5Q02045 173 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 MTMR3Q13615 1198 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 KCNJ12Q14500 433 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 MEA1Q16626 185 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 DDR2Q16832 855 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 VWA3BQ502W6 1294 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 TCP11X2Q5H9J9 407 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 SNX30Q5VWJ9 437 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 TRIM65Q6PJ69 517 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 ACOT1Q86TX2 421 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 UBALD2Q8IYN6 164 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 HS6ST3Q8IZP7 471 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 SLC4A11Q8NBS3 891 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 ZMIZ2Q8NF64 920 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 OVCA2Q8WZ82 227 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 TATDN2Q93075 761 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 TMEM176AQ96HP8 235 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 KREMEN1Q96MU8 473 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 ASB16Q96NS5 453 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 NT5C1BQ96P26 610 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 LPIN3Q9BQK8 851 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 DNAI2Q9GZS0 605 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 KCNK12Q9HB15 430 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 COMMD8Q9NX08 183 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 OBP2AQ9NY56 170 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 EHD2Q9NZN4 543 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 GCNT4Q9P109 453 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 MUTYHQ9UIF7 546 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 KIAA1257Q9ULG3 409 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 DUSP12Q9UNI6 340 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 SORCS3Q9UPU3 1222 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-213ENST00000548746 A0A1W2PRU2 124 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-213ENST00000548746 HHLA1C9JL84 531 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-213ENST00000548746 F8VP50 259 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-213ENST00000548746 O00370 1275 aa6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms