RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547188.1

PRDM4-202, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM4, Length 640 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-202ENST00000547188 TTC26A0AVF1 554 aa25.4■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa25.4■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 CYP3A5P20815 502 aa25.4■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 RGL4Q8IZJ4 473 aa25.4■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 LRRC15Q8TF66 581 aa25.4■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa25.4■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 KMT5AQ9NQR1 393 aa25.4■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 STK36Q9NRP7 1315 aa25.39■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 RPA1P27694 616 aa25.39■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 TNFSF9P41273 254 aa25.39■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 GRIK2Q13002 908 aa25.39■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 ECM1Q16610 540 aa25.39■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 TMEM206Q9H813 350 aa25.39■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa25.39■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 TMLHEQ9NVH6 421 aa25.39■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa25.39■■□□□ 1.66
PRDM4-202ENST00000547188 MYH11P35749 1972 aa25.38■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa25.38■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 C2orf78A6NCI8 922 aa25.38■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 LACTBL1A8MY62 500 aa25.38■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 SLC16A4O15374 487 aa25.38■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 ARHGAP6O43182 974 aa25.38■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 KAT7O95251 611 aa25.38■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 CSH1P0DML2 217 aa25.38■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 CSH2P0DML3 217 aa25.38■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 GABRG2P18507 467 aa25.38■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 MAOBP27338 520 aa25.38■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 KRT2P35908 639 aa25.38■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 C12orf40Q86WS4 652 aa25.38■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 DAW1Q8N136 415 aa25.38■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 ERLEC1Q96DZ1 483 aa25.38■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 PI4K2AQ9BTU6 479 aa25.38■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 HAPLN2Q9GZV7 340 aa25.38■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 IL21RQ9HBE5 538 aa25.38■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 MYMKA6NI61 221 aa25.37■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 TOM1L1O75674 476 aa25.37■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 CYP17A1P05093 508 aa25.37■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 CYP11A1P05108 521 aa25.37■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP25.37■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 KDSRQ06136 332 aa25.37■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 DDR2Q16832 855 aa25.37■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 PNKPQ96T60 521 aa25.37■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 GCNT4Q9P109 453 aa25.37■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 CYP8B1Q9UNU6 501 aa25.37■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 COL6A6A6NMZ7 2263 aa25.37■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 KNL1Q8NG31 2342 aa25.36■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 HIP1RO75146 1068 aa25.36■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 APODP05090 189 aa25.36■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 PSMA5P28066 241 aa25.36■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 ZXDBP98169 803 aa25.36■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 CFHR1Q03591 330 aa25.36■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 PPP2R3AQ06190 1150 aa25.36■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 ERMNQ8TAM6 284 aa25.36■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 SPATA18Q8TC71 538 aa25.36■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa25.36■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa25.35■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 CAPN9O14815 690 aa25.35■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 CLTAP09496 248 aa25.35■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 THEM5Q8N1Q8 247 aa25.35■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 GALNT15Q8N3T1 639 aa25.35■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 CLDN3O15551 220 aa25.34■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 XPOTO43592 962 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 DKK1O94907 266 aa25.34■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 SMARCB1Q12824 385 aa25.34■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP25.34■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 CCDC157Q569K6 752 aa25.34■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 SPATA1Q5VX52 437 aa25.34■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 C9orf57Q5W0N0 161 aa25.34■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 RUFY3Q7L099 469 aa25.34■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 METTL23Q86XA0 190 aa25.34■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 CLMPQ9H6B4 373 aa25.34■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 CD93Q9NPY3 652 aa25.34■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 ARHGEF4Q9NR80 690 aa25.34■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 UNC79Q9P2D8 2635 aa25.34■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 MGAQ8IWI9 3026 aa25.34■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 SFI1A8K8P3 1242 aa25.33■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 CYB561D2O14569 222 aa25.33■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 HDCP19113 662 aa25.33■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 MCM7P33993 719 aa25.33■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 WASP42768 502 aa25.33■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 MCL1Q07820 350 aa25.33■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 SCRN1Q12765 414 aa25.33■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 KCNB1Q14721 858 aa25.33■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 DHCR24Q15392 516 aa25.33■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 WSCD1Q658N2 575 aa25.33■■□□□ 1.65
PRDM4-202ENST00000547188 PCSK4Q6UW60 755 aa25.33■■□□□ 1.65
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