RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542337.5

DDB1-220, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene DDB1, Length 558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1-220ENST00000542337 CRTAC1Q9NQ79 661 aa21.61■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa21.61■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 ZDHHC9Q9Y397 364 aa21.61■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 MYO15AQ9UKN7 3530 aa21.6■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 RPN1P04843 607 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 USP17L7P0C7H9 530 aa21.6■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 SOX9P48436 509 aa21.6■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 NDUFA8P51970 172 aa21.6■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 MDH1BQ5I0G3 518 aa21.6■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 TMEM174Q8WUU8 243 aa21.6■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 DMAC2Q9NW81 257 aa21.6■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 A0A1W2PQ27 194 aa21.59■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 A0A1W2PQ64 194 aa21.59■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 A0A1W2PQD8 194 aa21.59■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 A8MXQ7 604 aa21.59■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 NR3C1P04150 777 aa21.59■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 CKMP06732 381 aa21.59■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 P4HA1P13674 534 aa21.59■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 CXCL12P48061 93 aa21.59■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 CASP4P49662 377 aa21.59■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 TNK2Q07912 1038 aa21.59■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 BECN1Q14457 450 aa21.59■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 CCDC142Q17RM4 750 aa21.59■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 ZNF699Q32M78 642 aa21.59■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 ZNF667Q5HYK9 610 aa21.59■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 TSSK4Q6SA08 328 aa21.59■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa21.59■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 PARD3BQ8TEW8 1205 aa21.59■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 EXOC4Q96A65 974 aa21.59■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 PCED1BQ96HM7 432 aa21.59■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 KCTD10Q9H3F6 313 aa21.59■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 CCL26Q9Y258 94 aa21.59■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 VPS13AQ96RL7 3174 aa21.59■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 F5P12259 2224 aa21.58■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa21.58■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 FAM160A1Q05DH4 1040 aa21.58■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 RUNX3Q13761 415 aa21.58■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 NCOA4Q13772 614 aa21.58■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 KCNB1Q14721 858 aa21.58■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 PON2Q15165 354 aa21.58■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 PDGFRLQ15198 375 aa21.58■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 CEP135Q66GS9 1140 aa21.58■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 SYNPOQ8N3V7 929 aa21.58■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 SPEM1Q8N4L4 309 aa21.58■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 RUBCNQ92622 972 aa21.58■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 FAM83CQ9BQN1 747 aa21.58■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 ELOVL4Q9GZR5 314 aa21.58■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa21.58■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
DDB1-220ENST00000542337 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa21.57■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 HDCP19113 662 aa21.57■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 PPP3CCP48454 512 aa21.57■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 CLDN10P78369 228 aa21.57■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa21.57■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 ZBTB44Q8NCP5 570 aa21.57■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 TTC16Q8NEE8 873 aa21.57■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 TMC2Q8TDI7 906 aa21.57■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 C8orf48Q96LL4 319 aa21.57■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 XYLT2Q9H1B5 865 aa21.57■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 EBF3Q9H4W6 596 aa21.57■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 VRTNQ9H8Y1 702 aa21.57■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 ATP8B3O60423 1300 aa21.56■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 PFKLP17858 780 aa21.56■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 RPL13P26373 211 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 TXNDC11Q6PKC3 985 aa21.56■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 KRBA2Q6ZNG9 492 aa21.56■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa21.56■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 NELL1Q92832 810 aa21.56■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 CHAMP1Q96JM3 812 aa21.56■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 TNIP3Q96KP6 325 aa21.56■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 CYP2S1Q96SQ9 504 aa21.56■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa21.55■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 F8VP50 259 aa21.55■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 IKBKBO14920 756 aa21.55■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 TADA3O75528 432 aa21.55■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 RHOBTB3O94955 611 aa21.55■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 IFNAR2P48551 515 aa21.55■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 NOP14P78316 857 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 MTF1Q14872 753 aa21.55■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 CPA6Q8N4T0 437 aa21.55■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 PLEKHO2Q8TD55 490 aa21.55■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 NCDNQ9UBB6 729 aa21.55■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 RAB23Q9ULC3 237 aa21.55■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa21.55■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 FAM186AA6NE01 2351 aa21.55■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.54■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 LILRB5O75023 590 aa21.54■■□□□ 1.04
DDB1-220ENST00000542337 ZNF202O95125 648 aa21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms