RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 NELL2Q99435 816 aa25.79■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 MED10Q9BTT4 135 aa25.79■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 NT5C1AQ9BXI3 368 aa25.79■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 IL21Q9HBE4 155 aa25.79■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 COMMD8Q9NX08 183 aa25.79■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 DACH1Q9UI36 760 aa25.79■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 ZNF263O14978 683 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 F11P03951 625 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 GLULP15104 373 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 FCARP24071 287 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 ASPAP45381 313 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 CDH8P55286 799 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 PLCB2Q00722 1185 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 INCA1Q0VD86 236 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 MLKLQ8NB16 471 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 ZSWIM3Q96MP5 696 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 CA14Q9ULX7 337 aa25.78■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 TRIM49BA6NDI0 452 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 HEPACAM2A8MVW5 462 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 BIN1O00499 593 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 PMM2O15305 246 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 P4HA2O15460 535 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 HCRTO43612 131 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 CCDC192P0DO97 292 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 AOC1P19801 751 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 PMS1P54277 932 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 STARD6P59095 220 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 SLC44A4Q53GD3 710 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 TTI2Q6NXR4 508 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 MON1AQ86VX9 555 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 CMTM8Q8IZV2 173 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 EEF2KMTQ96G04 330 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 SLITRK1Q96PX8 696 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 CTNND2Q9UQB3 1225 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 COQ4Q9Y3A0 265 aa25.77■■□□□ 1.72
PITX3-202ENST00000539804 MAN2B1O00754 1011 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 CHADO15335 359 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 NCAM2O15394 837 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 GPR15P49685 360 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 NDST1P52848 882 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 CAMK4Q16566 473 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 PDZD8Q8NEN9 1154 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 OSBPL6Q9BZF3 934 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 DPEP3Q9H4B8 488 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 CLSTN2Q9H4D0 955 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa25.76■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 CD44P16070 742 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 GDI1P31150 447 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 MAGEA9P43362 315 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 RAP1GAPP47736 663 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 PTPN5P54829 565 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 FCHO2Q0JRZ9 810 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 SPOPLQ6IQ16 392 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 VITQ6UXI7 678 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 OVCA2Q8WZ82 227 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 TTLL2Q9BWV7 592 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 B3GNT5Q9BYG0 378 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 NUP62CLQ9H1M0 184 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 TBC1D17Q9HA65 648 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 RWDD2AQ9UIY3 292 aa25.75■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 TRIOO75962 3097 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 KRBA1A5PL33 1030 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 F8VP50 259 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 USP17L7P0C7H9 530 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 CYP4F8P98187 520 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 ACOT1Q86TX2 421 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 NUP93Q8N1F7 819 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 MAB21L3Q8N8X9 362 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 BPIFB1Q8TDL5 484 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 SLC35C1Q96A29 364 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 SIT1Q9Y3P8 196 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 KANSL1LA0AUZ9 987 aa25.73■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 BMP6P22004 513 aa25.73■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 VIPR2P41587 438 aa25.73■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 CDR1P51861 262 aa25.73■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 MARSP56192 900 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 SDHAF4Q5VUM1 108 aa25.73■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 ZNF852Q6ZMS4 543 aa25.73■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 FAM35AQ86V20 835 aa25.73■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 STKLD1Q8NE28 680 aa25.73■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
PITX3-202ENST00000539804 SLC46A2Q9BY10 475 aa25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms