RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	IQCD	Q96DY2	449 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	GNRHR2	Q96P88	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	STK32B	Q9NY57	414 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	MAP3K5	Q99683	1374 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	NHS	Q6T4R5	1651 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089		F8W8V4	182 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	THAP12	O43422	761 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	ABHD16A	O95870	558 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	TSHR	P16473	764 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	CNR2	P34972	360 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	HAL	P42357	657 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	ARFIP2	P53365	341 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	DUSP8	Q13202	625 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	RNF44	Q7L0R7	432 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	USP37	Q86T82	979 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	SYT8	Q8NBV8	401 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	CCT6B	Q92526	530 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	SNX22	Q96L94	193 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	SCLT1	Q96NL6	688 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	COL20A1	Q9P218	1284 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	SLIT3	O75094	1523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	VPS4B	O75351	444 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	FGF18	O76093	207 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	CHEK2	O96017	543 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	SLC6A2	P23975	617 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	SLC6A4	P31645	630 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	CARS	P49589	748 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	EPHB4	P54760	987 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	UCP3	P55916	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	SATB1	Q01826	763 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	ERAP2	Q6P179	960 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC174	Q6PII3	467 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	BEND5	Q7L4P6	421 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF527	Q8NB42	609 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	PPM1E	Q8WY54	764 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	SCAMP4	Q969E2	229 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	CDYL	Q9Y232	598 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	USP54	Q70EL1	1684 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	TNS2	Q63HR2	1409 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC7	Q96M83	1385 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	DRGX	A6NNA5	263 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	CAPN14	A8MX76	684 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM233	B4DJY2	109 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	KIF20A	O95235	890 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	MT-ND5	P03915	603 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	FGFR2	P21802	821 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MDM2-223	ENST00000536089	CHN2	P52757	468 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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