RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 CDK7P50613 346 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 TFF2Q03403 129 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 SLFN5Q08AF3 891 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 RAPGEF1Q13905 1077 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 TMEM132BQ14DG7 1078 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 CNGA3Q16281 694 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 CPZQ66K79 652 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 TMC5Q6UXY8 1006 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 ANKS3Q6ZW76 656 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 USP53Q70EK8 1073 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 ZNF365Q70YC5 407 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 PROSER1Q86XN7 944 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 PEX5LQ8IYB4 626 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 C8orf48Q96LL4 319 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 SH3GL1Q99961 368 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 LRFN3Q9BTN0 628 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 JAM3Q9BX67 310 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 L2HGDHQ9H9P8 463 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 GPR108Q9NPR9 543 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 SEPT10Q9P0V9 454 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 MSRAQ9UJ68 235 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 CFAP45Q9UL16 551 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa8.55□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 ELP1O95163 1332 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 MYADML2A6NDP7 307 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 KLF4O43474 513 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 LAMTOR5O43504 91 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 MAFKO60675 156 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 SLC25A27O95847 323 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 TPM1P09493 284 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 TNFRSF1AP19438 455 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 CST5P28325 142 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 SMARCA1P28370 1054 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 KIF5BP33176 963 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 TSPAN7P41732 249 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 TRAPPC10P48553 1259 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 KCNQ1P51787 676 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 ZBTB17Q13105 803 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 BECN1Q14457 450 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 TBC1D25Q3MII6 688 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 PDXDC1Q6P996 788 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 KRT222Q8N1A0 295 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 TMEM199Q8N511 208 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 MAGEB6Q8N7X4 407 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 TEX19Q8NA77 164 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 STAG1Q8WVM7 1258 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 HERVK_113Q902F9 699 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 TBC1D31Q96DN5 1066 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 LRRCC1Q9C099 1032 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 TMEM168Q9H0V1 697 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 EPHX3Q9H6B9 360 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 SLC28A3Q9HAS3 691 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 ARHGEF4Q9NR80 690 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 CROTQ9UKG9 612 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa8.54□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 KRIT1O00522 736 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 IDH1O75874 414 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 CYP7B1O75881 506 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 CCDC173Q0VFZ6 552 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 SURF1Q15526 300 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 AAK1Q2M2I8 961 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 CCDC122Q5T0U0 273 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 LIMS2Q7Z4I7 341 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 SPICE1Q8N0Z3 855 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 SLC43A3Q8NBI5 491 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 MAML1Q92585 1016 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 GLT1D1Q96MS3 346 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 TCHPQ9BT92 498 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 IL23AQ9NPF7 189 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 CLIC5Q9NZA1 410 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 CNPY2Q9Y2B0 182 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 ZNF536O15090 1300 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 LCTP09848 1927 aa8.52□□□□□ -1.04
LMO3-212ENST00000535535 ERC2O15083 957 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 WDR46O15213 610 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 ADCY6O43306 1168 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 SGTAO43765 313 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 REC8O95072 547 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 KIAA0753Q2KHM9 967 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-212ENST00000535535 TMEM179Q6ZVK1 233 aa8.52□□□□□ -1.05
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