RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516299.1

RNU6-1232P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1232, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1232P, Length 86 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1232P-201ENST00000516299 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 TMEM184CQ9NVA4 438 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 FAM118AQ9NWS6 357 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SAMD15Q9P1V8 674 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CFAP97Q9P2B7 532 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CLIP2Q9UDT6 1046 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 MSRAQ9UJ68 235 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 KCNG2Q9UJ96 466 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 FZD10Q9ULW2 581 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 COG5Q9UP83 839 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SLC8A2Q9UPR5 921 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 USP22Q9UPT9 525 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CDYLQ9Y232 598 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SPO11Q9Y5K1 396 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ZHX2Q9Y6X8 837 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ADGRA2Q96PE1 1338 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 A0A1B0GVY2 172 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 BLACEA4D250 179 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CFAP69A5D8W1 941 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CDHR4A6H8M9 788 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 GAGE12JA6NER3 117 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 A8MU10 97 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SMTNL1A8MU46 457 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 M0R2C6 588 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 M0R3H8 397 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ARNTLO00327 626 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 PCDH17O14917 1159 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ADAMTS3O15072 1205 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 INPPL1O15357 1258 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 TBX1O43435 398 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 EDIL3O43854 480 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 EXTL3O43909 919 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 TMPRSS11DO60235 418 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 FGF17O60258 216 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 GPR32O75388 356 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 KRTAP5-8O75690 187 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 DDNO94850 711 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 AGFG2O95081 481 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ARIH2O95376 493 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 PLGP00747 810 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ASLP04424 464 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 UMODP07911 640 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ELANEP08246 267 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 WEE2P0C1S8 567 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 TRIM49P0CI25 452 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 TRIM49CP0CI26 452 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CETPP11597 493 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CYP2C9P11712 490 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 FCGR1AP12314 374 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 PPP3CBP16298 524 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CPEP16870 476 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 TFEBP19484 476 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SLC9A1P19634 815 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CDC25CP30307 473 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CIITAP33076 1130 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CYP2C19P33261 490 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 IGFALSP35858 605 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 KRT2P35908 639 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 LIPAP38571 399 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 GRIA2P42262 883 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 WASP42768 502 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 PTGER3P43115 390 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 POLD2P49005 469 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 PCYT1AP49585 367 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 NEK4P51957 841 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 COPB1P53618 953 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 KRTAP10-3P60369 221 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ARID5AQ03989 594 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 GAD2Q05329 585 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 COASYQ13057 564 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 MTX1Q13505 466 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 NOMO1Q15155 1222 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SHBQ15464 509 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 TCEA2Q15560 299 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SYT16Q17RD7 645 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 MST1LQ2TV78 715 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SLC10A6Q3KNW5 377 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 EFHC1Q5JVL4 640 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 MFSD14BQ5SR56 506 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 TREML2Q5T2D2 321 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 TMTC4Q5T4D3 741 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SOGA3Q5TF21 947 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 STPG1Q5TH74 334 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 DCAF12L1Q5VU92 463 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 AFMIDQ63HM1 303 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ISM2Q6H9L7 571 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 TAPT1Q6NXT6 567 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 ZNF449Q6P9G9 518 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 BTNL9Q6UXG8 535 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1232P-201ENST00000516299 SLC30A10Q6XR72 485 aa0.43□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms