RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513618.1

SPATA20-223, Transcript of spermatogenesis associated 20, human

TSL 2

Gene SPATA20, Length 629 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPATA20-223	ENST00000513618	TNNC2	P02585	160 aa		18.88	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	ELF2	Q15723	593 aa		18.88	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	EML3	Q32P44	896 aa		18.88	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		18.88	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		18.88	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		18.88	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	18.88	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	SPATA17	Q96L03	361 aa		18.88	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	CYP2S1	Q96SQ9	504 aa		18.88	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		18.88	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		18.88	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	VPS45	Q9NRW7	570 aa		18.88	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	INTS13	Q9NVM9	706 aa		18.88	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	GCNT4	Q9P109	453 aa		18.88	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		18.88	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		18.88	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	ZNF233	A6NK53	670 aa		18.87	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	RHOBTB1	O94844	696 aa		18.87	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	HDC	P19113	662 aa		18.87	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	MPL	P40238	635 aa		18.87	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	REST	Q13127	1097 aa		18.87	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	PLK5	Q496M5	336 aa		18.87	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		18.87	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	HPDL	Q96IR7	371 aa		18.87	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	HHIP	Q96QV1	700 aa		18.87	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	SLC22A12	Q96S37	553 aa		18.87	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	SYT15	Q9BQS2	421 aa		18.87	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		18.87	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		18.87	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	CACNA1B	Q00975	2339 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	TM4SF5	O14894	197 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	18.86	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	NFATC1	O95644	943 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	ANXA13	P27216	316 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	PPP3CC	P48454	512 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	DMC1	Q14565	340 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	SLC39A14	Q15043	492 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	STPG1	Q5TH74	334 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	C11orf74	Q86VG3	221 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		18.86	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	C2orf78	A6NCI8	922 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	TRIM66	O15016	1216 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	FAM163B	P0C2L3	166 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	18.85	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	GRIK1	P39086	918 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	18.85	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	PSMD2	Q13200	908 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	CCDC6	Q16204	474 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	ST3GAL2	Q16842	350 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	WDR49	Q8IV35	697 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	TTC16	Q8NEE8	873 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	MYLPF	Q96A32	169 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		18.85	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	HCRT	O43612	131 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	SYT1	P21579	422 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	KCNA4	P22459	653 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	LMO2	P25791	158 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	CCDC142	Q17RM4	750 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	FAM84A	Q96KN4	292 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	MMS19	Q96T76	1030 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	PANK2	Q9BZ23	570 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	TNMD	Q9H2S6	317 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	OBSL1	O75147	1896 aa		18.84	■□□□□ 0.61
SPATA20-223	ENST00000513618		A0A087X0B3	334 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	18.83	■□□□□ 0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	ATP2C2	O75185	946 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	KRT37	O76014	449 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	BDNF	P23560	247 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	SLC7A9	P82251	487 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	CYP27A1	Q02318	531 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	USP39	Q53GS9	565 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	USP28	Q96RU2	1077 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		18.83	■□□□□ 0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6

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