RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512611.5

RAPGEF6-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAPGEF6, Length 3,683 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-211ENST00000512611 CEP170P1Q96L14 293 aa7.17□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 DHRS4Q9BTZ2 278 aa7.17□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 TRIM55Q9BYV6 548 aa7.17□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM39BQ9GZU3 492 aa7.17□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 EBF3Q9H4W6 596 aa7.17□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 PLAC1Q9HBJ0 212 aa7.17□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa7.17□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 SAR1AQ9NR31 198 aa7.17□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC7A8Q9UHI5 535 aa7.17□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 CYTH4Q9UIA0 394 aa7.17□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 PACSIN3Q9UKS6 424 aa7.17□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 LRCH1Q9Y2L9 728 aa7.17□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 NR2E3Q9Y5X4 410 aa7.17□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 CST8O60676 142 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR6B1O95007 311 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 LYNP07948 512 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 WEE2P0C1S8 567 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 RTP1P59025 263 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 BASP1P80723 227 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 USP4Q13107 963 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 CUL2Q13617 745 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 RALGPS1Q5JS13 557 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 IRGCQ6NXR0 463 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 PALM2Q8IXS6 379 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 POU5F2Q8N7G0 328 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 HIPK4Q8NE63 616 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM174Q8WUU8 243 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 MAIP1Q8WWC4 291 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 JDP2Q8WYK2 163 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM143Q96AN5 459 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 FGD4Q96M96 766 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 FNBP1Q96RU3 617 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 SYNCQ9H7C4 482 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC17A6Q9P2U8 582 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 A6NJR5 290 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 KBTBD13C9JR72 458 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZWINTO95229 277 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 GSTT1P30711 240 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 TNFSF9P41273 254 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC18A1P54219 525 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 RPS6P62753 249 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 ARHGAP8P85298 464 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC25A3Q00325 362 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 OCRLQ01968 901 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 PTK7Q13308 1070 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZACNQ401N2 412 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 MTHFD1LQ6UB35 978 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 BBOF1Q8ND07 529 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC35B2Q8TB61 432 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 SMYD2Q9NRG4 433 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 GABBR1Q9UBS5 961 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 SCOCQ9UIL1 159 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 CAPN14A8MX76 684 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 F5H423 210 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 DHRS4L1P0CG22 281 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 ANPEPP15144 967 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 MMP8P22894 467 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCNFP41002 786 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 HSD17B4P51659 736 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 PDE1BQ01064 536 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 TFDP3Q5H9I0 405 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 SWSAP1Q6NVH7 229 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 RCOR2Q8IZ40 523 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 UNC5BQ8IZJ1 945 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 TTLL6Q8N841 843 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 FBXO41Q8TF61 875 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 PGLYRP2Q96PD5 576 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 ACSS3Q9H6R3 686 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 PARVAQ9NVD7 372 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 CNTN3Q9P232 1028 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC24A2Q9UI40 661 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 PLA2G4CQ9UP65 541 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 RIPK3Q9Y572 518 aa7.16□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 STBD1O95210 358 aa7.15□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 MT-ND3P03897 115 aa7.15□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 CAP2P40123 477 aa7.15□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 MCL1Q07820 350 aa7.15□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 BST1Q10588 318 aa7.15□□□□□ -1.26
RAPGEF6-211ENST00000512611 CNPY1Q3B7I2 92 aa7.15□□□□□ -1.26
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