RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 SYT13Q7L8C5 426 aa32.36■■■□□ 2.77
ALYREF-202ENST00000505490 SYCP3Q8IZU3 236 aa32.36■■■□□ 2.77
ALYREF-202ENST00000505490 CPA6Q8N4T0 437 aa32.36■■■□□ 2.77
ALYREF-202ENST00000505490 SPATA17Q96L03 361 aa32.36■■■□□ 2.77
ALYREF-202ENST00000505490 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa32.35■■■□□ 2.77
ALYREF-202ENST00000505490 SYT1P21579 422 aa32.35■■■□□ 2.77
ALYREF-202ENST00000505490 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
ALYREF-202ENST00000505490 ATP2A3Q93084 1043 aa32.35■■■□□ 2.77
ALYREF-202ENST00000505490 EXOC4Q96A65 974 aa32.35■■■□□ 2.77
ALYREF-202ENST00000505490 PCIF1Q9H4Z3 704 aa32.35■■■□□ 2.77
ALYREF-202ENST00000505490 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP32.35■■■□□ 2.77
ALYREF-202ENST00000505490 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP32.35■■■□□ 2.77
ALYREF-202ENST00000505490 EBF1Q9UH73 591 aa32.35■■■□□ 2.77
ALYREF-202ENST00000505490 LAMA1P25391 3075 aa32.34■■■□□ 2.77
ALYREF-202ENST00000505490 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
ALYREF-202ENST00000505490 KRT19P08727 400 aa32.34■■■□□ 2.77
ALYREF-202ENST00000505490 STAT6P42226 847 aa32.34■■■□□ 2.77
ALYREF-202ENST00000505490 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP32.34■■■□□ 2.77
ALYREF-202ENST00000505490 OR5B17Q8NGF7 314 aa32.34■■■□□ 2.77
ALYREF-202ENST00000505490 CDH9Q9ULB4 789 aa32.34■■■□□ 2.77
ALYREF-202ENST00000505490 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa32.34■■■□□ 2.77
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM191BP0C7N4 346 aa32.33■■■□□ 2.77
ALYREF-202ENST00000505490 PFKLP17858 780 aa32.33■■■□□ 2.77
ALYREF-202ENST00000505490 VSTM1Q6UX27 236 aa32.33■■■□□ 2.77
ALYREF-202ENST00000505490 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP32.33■■■□□ 2.77
ALYREF-202ENST00000505490 CD101Q93033 1021 aa32.33■■■□□ 2.77
ALYREF-202ENST00000505490 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa32.33■■■□□ 2.77
ALYREF-202ENST00000505490 USP28Q96RU2 1077 aa32.33■■■□□ 2.77
ALYREF-202ENST00000505490 CRTAC1Q9NQ79 661 aa32.33■■■□□ 2.77
ALYREF-202ENST00000505490 RXFP3Q9NSD7 469 aa32.33■■■□□ 2.77
ALYREF-202ENST00000505490 WNT6Q9Y6F9 365 aa32.33■■■□□ 2.77
ALYREF-202ENST00000505490 C2orf78A6NCI8 922 aa32.32■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 ATP2C2O75185 946 aa32.32■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 LMO2P25791 158 aa32.32■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 HOXD13P35453 343 aa32.32■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 MYO1EQ12965 1108 aa32.32■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 PLK5Q496M5 336 aa32.32■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 C4orf50Q6ZRC1 276 aa32.32■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 KIAA1958Q8N8K9 716 aa32.32■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 FSIP1Q8NA03 581 aa32.32■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 HPDLQ96IR7 371 aa32.32■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 TRPC7Q9HCX4 862 aa32.32■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 USP24Q9UPU5 2620 aa32.31■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 CKMP06732 381 aa32.31■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 CCDC192P0DO97 292 aa32.31■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 ZXDBP98169 803 aa32.31■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 SURF1Q15526 300 aa32.31■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP32.31■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 GLIS3Q8NEA6 775 aa32.31■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa32.31■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 SH3RF2Q8TEC5 729 aa32.31■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 SYT15Q9BQS2 421 aa32.31■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 TTLL2Q9BWV7 592 aa32.31■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 PANK2Q9BZ23 570 aa32.31■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP32.31■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF233A6NK53 670 aa32.3■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP32.3■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 WARSP23381 471 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 IFNAR2P48551 515 aa32.3■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 NASPP49321 788 aaPredicted RBP32.3■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 DUOXA2Q1HG44 320 aa32.3■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP32.3■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 CBWD2Q8IUF1 395 aa32.3■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 SCN4BQ8IWT1 228 aa32.3■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 CCDC65Q8IXS2 484 aa32.3■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 HHIPQ96QV1 700 aa32.3■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 TNMDQ9H2S6 317 aa32.3■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 KBTBD4Q9NVX7 518 aa32.3■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP32.3■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 MTMR6Q9Y217 621 aa32.3■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 E2F4Q16254 413 aa32.29■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 GAB4Q2WGN9 574 aa32.29■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 MYLPFQ96A32 169 aa32.29■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 ACDQ96AP0 544 aa32.29■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 LINC00597Q9H2U6 94 aa32.29■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 KRT37O76014 449 aa32.28■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 FAM163BP0C2L3 166 aa32.28■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 HDCP19113 662 aa32.28■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 PDE6CP51160 858 aa32.28■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 DMC1Q14565 340 aa32.28■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 CCDC6Q16204 474 aa32.28■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 IL31Q6EBC2 164 aa32.28■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 CNNM4Q6P4Q7 775 aa32.28■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 WDR49Q8IV35 697 aa32.28■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 KIAA1586Q9HCI6 787 aa32.28■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 HSPBP1Q9NZL4 362 aa32.28■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 NME7Q9Y5B8 376 aa32.28■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 APBB3O95704 486 aa32.27■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 OLFM2O95897 454 aa32.27■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 TNNC2P02585 160 aa32.27■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 MPLP40238 635 aa32.27■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 USP46P62068 366 aa32.27■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 KCNB1Q14721 858 aa32.27■■■□□ 2.76
ALYREF-202ENST00000505490 VPS45Q9NRW7 570 aa32.27■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms