RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 MIS12Q9H081 205 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 TMBIM4Q9HC24 238 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 KLHL11Q9NVR0 708 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 WHRNQ9P202 907 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 LRCH4O75427 683 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 TJP3O95049 919 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 PFKMP08237 780 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 RARBP10826 455 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ITIH2P19823 946 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 IVDP26440 423 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 PMS2P54278 862 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 NKX3-2P78367 333 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ADCY2Q08462 1091 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF844Q08AG5 666 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 CALCOCO2Q13137 446 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 PKDCCQ504Y2 493 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 TFDP3Q5H9I0 405 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 FBXO47Q5MNV8 452 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 UBA3Q8TBC4 463 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF560Q96MR9 790 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 DEFB118Q96PH6 123 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 APOL6Q9BWW8 343 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 EPB41L4BQ9H329 900 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 NEU2Q9Y3R4 380 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 IPPQ9Y573 584 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 NME7Q9Y5B8 376 aa8.63□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 GOLGA6L10A6NI86 522 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 PI4K2BG5E9Z4 385 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 TP73O15350 636 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 KRT7P08729 469 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 NUDT17P0C025 328 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 SETSIPP0DME0 302 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 PNPLA4P41247 253 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 CDKN2BP42772 138 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 HADHQ16836 314 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 SOWAHAQ2M3V2 549 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ODF2Q5BJF6 829 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 GNASQ5JWF2 1037 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 EMC10Q5UCC4 262 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 DPH6Q7L8W6 267 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 FAM228AQ86W67 206 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 EMC1Q8N766 993 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 C12orf29Q8N999 325 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 OR2W6PQ8NHA6 318 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 RAPGEF5Q92565 580 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 SNF8Q96H20 258 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 GDAP2Q9NXN4 497 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 EFR3BQ9Y2G0 817 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 FRMPD3Q5JV73 1810 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 LRRD1A4D1F6 860 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 E5RJQ4 531 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 MYZAPP0CAP1 466 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 KRT10P13645 584 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 CAPN2P17655 700 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 LMNB2Q03252 620 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 SLMAPQ14BN4 828 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 RHBDF2Q6PJF5 856 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ACOT1Q86TX2 421 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 TTC30AQ86WT1 665 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 TNS4Q8IZW8 715 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC114Q96M63 670 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM106CQ9BVX2 250 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 KLK14Q9P0G3 267 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ASIC3Q9UHC3 531 aa8.62□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 KPNA7A9QM74 516 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 M0QZ92 97 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 LIASO43766 372 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 RARGP13631 454 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 IL1R2P27930 398 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 PCK1P35558 622 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 SKOR1P84550 965 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 CAV1Q03135 178 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 TAZQ16635 292 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 NBPF20Q3BBV1 942 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 KAZNQ674X7 775 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 KCTD16Q68DU8 428 aa8.61□□□□□ -1.03
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