RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	EMC10	Q5UCC4	262 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	XPR1	Q9UBH6	696 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	TJP3	O95049	919 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	GRP	P07492	148 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	LINC00205	P59089	165 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	GPSM2	P81274	684 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	E2F2	Q14209	437 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	LRRC41	Q15345	812 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	PGS1	Q32NB8	556 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	NRAC	Q8N912	160 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	TERB1	Q8NA31	727 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	SLC35A4	Q96G79	324 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	GABRQ	Q9UN88	632 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	TTC3	P53804	2025 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268		E5RJQ4	531 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	ALDH2	P05091	517 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	RENBP	P51606	427 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	UCP3	P55916	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	MYO1E	Q12965	1108 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	CYP1B1	Q16678	543 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	FAM167A	Q96KS9	214 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	ARMT1	Q9H993	441 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268		H7C1Q1	480 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	AP4M1	O00189	453 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	KCNJ5	P48544	419 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	MVB12A	Q96EY5	273 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	HMCES	Q96FZ2	354 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	CIPC	Q9C0C6	399 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	ASIC5	Q9NY37	505 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	ALG1L2	C9J202	215 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	ADAM10	O14672	748 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	IL33	O95760	270 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	IL1R2	P27930	398 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	VIPR2	P41587	438 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	PSG6	Q00889	435 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	E2F1	Q01094	437 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	KLHL22	Q53GT1	634 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	CCDC157	Q569K6	752 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	PRR25	Q96S07	402 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	MESP1	Q9BRJ9	268 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	STAP2	Q9UGK3	403 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	CPA4	Q9UI42	421 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	DTNB	O60941	627 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	CCKBR	P32239	447 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	SLC11A2	P49281	568 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	TPTE	P56180	551 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
USP34-222	ENST00000498268	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67

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