RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496372.1

CNIH3-212, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNIH3, Length 451 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3-212ENST00000496372 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 HELZP42694 1942 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 F8VP50 259 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 TRIM66O15016 1216 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 TEX33O43247 280 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 AP1G2O75843 785 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 SERPINC1P01008 464 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 RHOP08100 348 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 PAEPP09466 180 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 MYL4P12829 197 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 KRT5P13647 590 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 CD19P15391 556 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 FSHRP23945 695 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 ANXA13P27216 316 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 ADORA2BP29275 332 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 USP8P40818 1118 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 KLK7P49862 253 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 ZNF132P52740 706 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 SYCP1Q15431 976 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 TAF12Q16514 161 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 FILIP1LQ4L180 1135 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 SGO2Q562F6 1265 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 TJAP1Q5JTD0 557 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 FAM35AQ86V20 835 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 RNF214Q8ND24 703 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 STKLD1Q8NE28 680 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 PSMG2Q969U7 264 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 SMARCD1Q96GM5 515 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 C8orf48Q96LL4 319 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 ERGIC2Q96RQ1 377 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 PLCB1Q9NQ66 1216 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 ASAH2Q9NR71 780 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 KRT82Q9NSB4 513 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 TMEM30AQ9NV96 361 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 PRKAG3Q9UGI9 489 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 DNAJC12Q9UKB3 198 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 KIAA1257Q9ULG3 409 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 CNTN6Q9UQ52 1028 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 SIK3Q9Y2K2 1263 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 FHOD1Q9Y613 1164 aa8.35□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 A0A1B0GTH6 734 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 SLC38A8A6NNN8 435 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 NOL4O94818 638 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 CALCAP01258 141 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 FAM200BP0CF97 657 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 CSH1P0DML2 217 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 CSH2P0DML3 217 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 VDRP11473 427 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 UCHL3P15374 230 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 RFX1P22670 979 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 SP100P23497 879 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 EPHA5P54756 1037 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 FANCCQ00597 558 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 ZP2Q05996 745 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 MTMR3Q13615 1198 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 RAPGEF1Q13905 1077 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 SLC5A9Q2M3M2 681 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 CYP4A22Q5TCH4 519 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 ARHGAP17Q68EM7 881 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 TMC8Q8IU68 726 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 ADHFE1Q8IWW8 467 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 LEMD2Q8NC56 503 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 NEK11Q8NG66 645 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 ITFG1Q8TB96 612 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 ING5Q8WYH8 240 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 TFAP2BQ92481 460 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 SHC3Q92529 594 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 TCEAL4Q96EI5 215 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 SPATA17Q96L03 361 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 KCNK16Q96T55 309 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 SMOQ99835 787 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 LRRC3Q9BY71 257 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 GANQ9H2C0 597 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 NR2E1Q9Y466 385 aa8.34□□□□□ -1.07
CNIH3-212ENST00000496372 C2CD4DB7Z1M9 353 aa8.33□□□□□ -1.08
CNIH3-212ENST00000496372 O00370 1275 aa8.33□□□□□ -1.08
CNIH3-212ENST00000496372 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CNIH3-212ENST00000496372 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CNIH3-212ENST00000496372 ZNF197O14709 1029 aa8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms