RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 QSOX1O00391 747 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 ERC2O15083 957 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 LILRA4P59901 499 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 KRT17Q04695 432 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 RAB32Q13637 225 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 PPP2R5AQ15172 486 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 ARHGAP40Q5TG30 622 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 VPS53Q5VIR6 699 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 CEP85Q6P2H3 762 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 SLC29A4Q7RTT9 530 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 RASAL3Q86YV0 1011 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 CHPFQ8IZ52 775 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 TBC1D5Q92609 795 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 RFKQ969G6 155 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 TAAR9Q96RI9 348 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 FAM204AQ9H8W3 233 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 GLOD4Q9HC38 313 aa5.82□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 ABCA8O94911 1581 aa5.81□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 GOLGA6CA6NDK9 693 aa5.81□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 GOLGA6BA6NDN3 693 aa5.81□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 PPM1DO15297 605 aa5.81□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 TBC1D4O60343 1298 aa5.81□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 FAM163BP0C2L3 166 aa5.81□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 GOLGA6DP0CG33 693 aa5.81□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 FCRLBQ6BAA4 426 aa5.81□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa5.81□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 HASPINQ8TF76 798 aa5.81□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 C1orf112Q9NSG2 853 aa5.81□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 SERTAD4Q9NUC0 356 aa5.81□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa5.81□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 GABBR1Q9UBS5 961 aa5.81□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 STAP2Q9UGK3 403 aa5.81□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 SERTAD3Q9UJW9 196 aa5.81□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 CD109Q6YHK3 1445 aa5.81□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 ADGRL1O94910 1474 aa5.8□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 CAPN8A6NHC0 703 aa5.8□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 VWC2LB2RUY7 222 aa5.8□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 DLDP09622 509 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 DRD4P21917 467 aa5.8□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 SLC11A2P49281 568 aa5.8□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 ZNF134P52741 427 aa5.8□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 UCP3P55916 312 aa5.8□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 PLEKHG6Q3KR16 790 aa5.8□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 FAM102BQ5T8I3 360 aa5.8□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 PPP4R4Q6NUP7 873 aa5.8□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 AMIGO2Q86SJ2 522 aa5.8□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 SLC15A3Q8IY34 581 aa5.8□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 LRRC71Q8N4P6 559 aa5.8□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 ZBTB34Q8NCN2 500 aa5.8□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 LRRC3CA6NJW4 275 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 DCLK1O15075 740 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 C1QL1O75973 258 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 JTBO76095 146 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 PDE6CP51160 858 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 PDE1AP54750 535 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 TPTEP56180 551 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 B3GNT9Q6UX72 402 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 ZNF788Q6ZQV5 615 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP5.79□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 FANCBQ8NB91 859 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 PLBD2Q8NHP8 589 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 MRGPRX1Q96LB2 322 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 TRIM54Q9BYV2 358 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 ARAP3Q8WWN8 1544 aa5.79□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 BTN3A1O00481 513 aa5.78□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 TUSC2O75896 110 aa5.78□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 PRKCGP05129 697 aa5.78□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP5.78□□□□□ -1.488e-17■□□□□ 9.4
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RBM39-241ENST00000496183 CACNB3P54284 484 aa5.78□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 SLC13A2Q13183 592 aa5.78□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 TBC1D25Q3MII6 688 aa5.78□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 TREML2Q5T2D2 321 aa5.78□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa5.78□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 NXNQ6DKJ4 435 aa5.78□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 MTHFD1LQ6UB35 978 aa5.78□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 NPNTQ6UXI9 565 aa5.78□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 MAEAQ7L5Y9 396 aa5.78□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 MPP5Q8N3R9 675 aa5.78□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 SLC15A4Q8N697 577 aa5.78□□□□□ -1.48
RBM39-241ENST00000496183 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa5.78□□□□□ -1.48
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