RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 TRPC7Q9HCX4 862 aa24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 HSPBP1Q9NZL4 362 aa24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 CDH9Q9ULB4 789 aa24.16■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 HCRTO43612 131 aa24.15■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 CKMP06732 381 aa24.15■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 USP4Q13107 963 aa24.15■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 VSTM1Q6UX27 236 aa24.15■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 WDR49Q8IV35 697 aa24.15■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 SCN4BQ8IWT1 228 aa24.15■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 GLIS3Q8NEA6 775 aa24.15■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 OSCP1Q8WVF1 389 aa24.15■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 SPATA17Q96L03 361 aa24.15■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 SYT15Q9BQS2 421 aa24.15■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 MYOFQ9NZM1 2061 aa24.14■■□□□ 1.46
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC30A4O14863 429 aa24.14■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 SPTLC2O15270 562 aa24.14■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 PPP6R2O75170 966 aa24.14■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 HOXC13P31276 330 aa24.14■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 HOXD13P35453 343 aa24.14■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 AMPD3Q01432 767 aa24.14■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 FBXO43Q4G163 708 aa24.14■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 CNNM4Q6P4Q7 775 aa24.14■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 GAB3Q8WWW8 586 aa24.14■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 ATP2A3Q93084 1043 aa24.14■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 HPS3Q969F9 1004 aa24.14■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC22A12Q96S37 553 aa24.14■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 ECT2Q9H8V3 914 aa24.14■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
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TRDMT1-211ENST00000495022 SLC8A2Q9UPR5 921 aa24.14■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 MYH10P35580 1976 aa24.13■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 NUP205Q92621 2012 aa24.13■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 DCDC2BA2VCK2 349 aa24.13■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 RNF40O75150 1001 aa24.13■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 EGFP01133 1207 aa24.13■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 TCF3P15923 654 aa24.13■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 WARSP23381 471 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 GJA4P35212 333 aa24.13■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 PDE6CP51160 858 aa24.13■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 CAMKK1Q8N5S9 505 aa24.13■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 MYLPFQ96A32 169 aa24.13■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 LOXL4Q96JB6 756 aa24.13■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 CYP2S1Q96SQ9 504 aa24.13■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 P2RY13Q9BPV8 354 aa24.13■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 GCNT4Q9P109 453 aa24.13■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 ATP2C2O75185 946 aa24.12■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 RPP40O75818 363 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 PFKLP17858 780 aa24.12■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 LMO2P25791 158 aa24.12■■□□□ 1.45
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TRDMT1-211ENST00000495022 KCNB1Q14721 858 aa24.12■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF507Q8TCN5 953 aa24.12■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
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TRDMT1-211ENST00000495022 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 UBE4BO95155 1302 aa24.11■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 AKAP3O75969 853 aa24.11■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 EML3Q32P44 896 aa24.11■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa24.11■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa24.11■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 IQUBQ8NA54 791 aa24.11■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 FOXD4L1Q9NU39 408 aa24.11■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa24.11■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 ABCA7Q8IZY2 2146 aa24.1■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 C2orf78A6NCI8 922 aa24.1■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 YEATS4O95619 227 aa24.1■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 BDNFP23560 247 aa24.1■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM26FQ5R3K3 315 aa24.1■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 SH3RF2Q8TEC5 729 aa24.1■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 CD101Q93033 1021 aa24.1■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 DHX58Q96C10 678 aa24.1■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 MMS19Q96T76 1030 aa24.1■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa24.1■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 EHD2Q9NZN4 543 aa24.1■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 WNT6Q9Y6F9 365 aa24.1■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 TRIM66O15016 1216 aa24.09■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 CUTAO60888 179 aa24.09■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM163BP0C2L3 166 aa24.09■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 HDCP19113 662 aa24.09■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 GRIK1P39086 918 aa24.09■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 RAP1GAPP47736 663 aa24.09■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 PXNP49023 591 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 NR1H3Q13133 447 aa24.09■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa24.09■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa24.09■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 FNBP1Q96RU3 617 aa24.09■■□□□ 1.45
TRDMT1-211ENST00000495022 C7orf25Q9BPX7 421 aa24.09■■□□□ 1.45
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