RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 TMEM253P0C7T8 217 aa23.3■■□□□ 1.32
PSPC1-204ENST00000492741 NPR3P17342 541 aa23.3■■□□□ 1.32
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PSPC1-204ENST00000492741 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
PSPC1-204ENST00000492741 PKDCCQ504Y2 493 aa23.3■■□□□ 1.32
PSPC1-204ENST00000492741 C2CD6Q53TS8 623 aa23.3■■□□□ 1.32
PSPC1-204ENST00000492741 LIN9Q5TKA1 542 aa23.3■■□□□ 1.32
PSPC1-204ENST00000492741 PGLYRP2Q96PD5 576 aa23.3■■□□□ 1.32
PSPC1-204ENST00000492741 CYTH4Q9UIA0 394 aa23.3■■□□□ 1.32
PSPC1-204ENST00000492741 BACE2Q9Y5Z0 518 aa23.3■■□□□ 1.32
PSPC1-204ENST00000492741 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
PSPC1-204ENST00000492741 TBC1D4O60343 1298 aa23.29■■□□□ 1.32
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PSPC1-204ENST00000492741 MMP8P22894 467 aa23.29■■□□□ 1.32
PSPC1-204ENST00000492741 BMP8BP34820 402 aa23.29■■□□□ 1.32
PSPC1-204ENST00000492741 RGS7P49802 495 aa23.29■■□□□ 1.32
PSPC1-204ENST00000492741 MAP3K7CLP57077 242 aa23.29■■□□□ 1.32
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PSPC1-204ENST00000492741 MON1BQ7L1V2 547 aa23.29■■□□□ 1.32
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PSPC1-204ENST00000492741 AUTS2Q8WXX7 1259 aa23.29■■□□□ 1.32
PSPC1-204ENST00000492741 VCPIP1Q96JH7 1222 aa23.29■■□□□ 1.32
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PSPC1-204ENST00000492741 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa23.29■■□□□ 1.32
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PSPC1-204ENST00000492741 DUSP10Q9Y6W6 482 aa23.29■■□□□ 1.32
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PSPC1-204ENST00000492741 ARHGEF15O94989 841 aa23.28■■□□□ 1.32
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PSPC1-204ENST00000492741 RGS19P49795 217 aa23.28■■□□□ 1.32
PSPC1-204ENST00000492741 SNX16P57768 344 aa23.28■■□□□ 1.32
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PSPC1-204ENST00000492741 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa23.28■■□□□ 1.32
PSPC1-204ENST00000492741 CPXM1Q96SM3 734 aa23.28■■□□□ 1.32
PSPC1-204ENST00000492741 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa23.28■■□□□ 1.32
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PSPC1-204ENST00000492741 TULP2O00295 520 aa23.28■■□□□ 1.32
PSPC1-204ENST00000492741 CSPG5O95196 566 aa23.28■■□□□ 1.32
PSPC1-204ENST00000492741 ABL1P00519 1130 aa23.28■■□□□ 1.32
PSPC1-204ENST00000492741 RB1P06400 928 aa23.28■■□□□ 1.32
PSPC1-204ENST00000492741 MYBL1P10243 752 aa23.28■■□□□ 1.32
PSPC1-204ENST00000492741 NOP2P46087 812 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
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PSPC1-204ENST00000492741 CTSAP10619 480 aa23.27■■□□□ 1.32
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PSPC1-204ENST00000492741 SLC8B1Q6J4K2 584 aa23.27■■□□□ 1.32
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF662Q6ZS27 426 aa23.27■■□□□ 1.32
PSPC1-204ENST00000492741 SPRED2Q7Z698 418 aa23.27■■□□□ 1.32
PSPC1-204ENST00000492741 CLSTN3Q9BQT9 956 aa23.27■■□□□ 1.32
PSPC1-204ENST00000492741 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa23.27■■□□□ 1.32
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PSPC1-204ENST00000492741 CXCL14O95715 111 aa23.26■■□□□ 1.31
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PSPC1-204ENST00000492741 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa23.26■■□□□ 1.31
PSPC1-204ENST00000492741 SCN4BQ8IWT1 228 aa23.26■■□□□ 1.31
PSPC1-204ENST00000492741 ATAD1Q8NBU5 361 aa23.26■■□□□ 1.31
PSPC1-204ENST00000492741 STK32AQ8WU08 396 aa23.26■■□□□ 1.31
PSPC1-204ENST00000492741 POF1BQ8WVV4 589 aa23.26■■□□□ 1.31
PSPC1-204ENST00000492741 ARHGEF26Q96DR7 871 aa23.26■■□□□ 1.31
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PSPC1-204ENST00000492741 SMOQ99835 787 aa23.26■■□□□ 1.31
PSPC1-204ENST00000492741 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa23.26■■□□□ 1.31
PSPC1-204ENST00000492741 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa23.26■■□□□ 1.31
PSPC1-204ENST00000492741 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
PSPC1-204ENST00000492741 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa23.26■■□□□ 1.31
PSPC1-204ENST00000492741 CEP290O15078 2479 aa23.26■■□□□ 1.31
PSPC1-204ENST00000492741 ADAM12O43184 909 aa23.25■■□□□ 1.31
PSPC1-204ENST00000492741 BUB1O43683 1085 aa23.25■■□□□ 1.31
PSPC1-204ENST00000492741 RRM1P23921 792 aa23.25■■□□□ 1.31
PSPC1-204ENST00000492741 ACADSBP45954 432 aa23.25■■□□□ 1.31
PSPC1-204ENST00000492741 PLA2G4AP47712 749 aa23.25■■□□□ 1.31
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