RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 CKAP2LQ8IYA6 745 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 THNSL1Q8IYQ7 743 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC39A11Q8N1S5 342 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 RDM1Q8NG50 284 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 ETNPPLQ8TBG4 499 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 CFAP54Q96N23 3096 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF558Q96NG5 402 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 UNC45AQ9H3U1 944 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 CHST12Q9NRB3 414 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 SPG21Q9NZD8 308 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 VPS54Q9P1Q0 977 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 AKT3Q9Y243 479 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 C2orf71A6NGG8 1288 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 GAS7O60861 476 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF623O75123 536 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 MPOP05164 745 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 FGFR4P22455 802 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 PSMA5P28066 241 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 PPM1AP35813 382 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 PBX3P40426 434 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 TECP42680 631 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 JAK3P52333 1124 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 KRT17Q04695 432 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 SIGLEC14Q08ET2 396 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 XKR3Q5GH77 459 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 PLPP4Q5VZY2 271 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 MOXD1Q6UVY6 613 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 LRRC43Q8N309 656 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM52Q8NDY8 209 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 PRSS33Q8NF86 280 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC148Q8NFR7 591 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 TBCKQ8TEA7 893 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 RSPH1Q8WYR4 309 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 GJA10Q969M2 543 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 PTCHD1Q96NR3 888 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 MAP7D2Q96T17 732 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 TCF25Q9BQ70 676 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC26A6Q9BXS9 759 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 IRAK3Q9Y616 596 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 NLRC5Q86WI3 1866 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A1W2PQJ5 194 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 ANKRD34BA5PLL1 514 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 MAFO75444 373 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 NAT2P11245 290 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 CFPP27918 469 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 BCAR1P56945 870 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 ERVFRD-1P60508 538 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 CCT2P78371 535 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 TCF15Q12870 199 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 PTPN21Q16825 1174 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 DPY19L1Q2PZI1 675 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 LRCH2Q5VUJ6 765 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 GALNT17Q6IS24 598 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 ANO5Q75V66 913 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 RUFY3Q7L099 469 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 CASP10Q92851 521 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 PRRX2Q99811 253 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 SGPP1Q9BX95 441 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 TEKT3Q9BXF9 490 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 C22orf23Q9BZE7 217 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 TM6SF1Q9BZW5 370 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 ADAM7Q9H2U9 754 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 IFT122Q9HBG6 1241 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 SIRT5Q9NXA8 310 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 DACT1Q9NYF0 836 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 ACSL6Q9UKU0 697 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 VPS13AQ96RL7 3174 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A087WZ62 844 aa7.11□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM150BA6NC51 233 aa7.11□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 NUDT19A8MXV4 375 aa7.11□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa7.11□□□□□ -1.27
PRPF40A-210ENST00000489741 HRKO00198 91 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms