RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 UBXN6Q9BZV1 441 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 HAUS4Q9H6D7 363 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 TLR9Q9NR96 1032 aa12.41□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 O00370 1275 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 ARHGAP6O43182 974 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 NCK2O43639 380 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 GFRA3O60609 400 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 LILRB3O75022 631 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 TBX10O75333 385 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 NDUFV1P49821 464 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 ARID5AQ03989 594 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 TCF15Q12870 199 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 RAB33AQ14088 237 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 CTC1Q2NKJ3 1217 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 CFAP221Q4G0U5 840 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 VSTM1Q6UX27 236 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 TAS1R1Q7RTX1 841 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 TMC7Q7Z402 723 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 ANKRD52Q8NB46 1076 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 MSANTD4Q8NCY6 345 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 STK32AQ8WU08 396 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 POF1BQ8WVV4 589 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 NOX5Q96PH1 765 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 TWNKQ96RR1 684 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 PKMYT1Q99640 499 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 SYT11Q9BT88 431 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 MIS12Q9H081 205 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 PDCL3Q9H2J4 239 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 DEF6Q9H4E7 631 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 CYLDQ9NQC7 956 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 HMGXB4Q9UGU5 601 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 DPP7Q9UHL4 492 aa12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP12.4□□□□□ -0.42
NISCH-211ENST00000488243 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 FSCN2O14926 492 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 CXCL14O95715 111 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 ADH1AP07327 375 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 MAGEA11P43364 429 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 BCAT1P54687 386 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 KRT83P78385 493 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 PTPN14Q15678 1187 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 SLC18A3Q16572 532 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 TMEM35BQ8NCS4 154 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 OR10T2Q8NGX3 314 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 ZNF461Q8TAF7 563 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 PPP2R3CQ969Q6 453 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 PRRX2Q99811 253 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP12.39□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 PNPLA8Q9NP80 782 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 CRTAC1Q9NQ79 661 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 CD207Q9UJ71 328 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 GTF3C4Q9UKN8 822 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa12.39□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 SPTBN4Q9H254 2564 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 MYBPHLA2RUH7 354 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 AKR1B10O60218 316 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 ABLIM3O94929 683 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 LCA5LO95447 670 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 SKILP12757 684 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 CPB1P15086 417 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 BRD2P25440 801 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 TUFMP49411 452 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 FMO1Q01740 532 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 BST2Q10589 180 aaKnown RBP12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 SPA17Q15506 151 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 MDH1BQ5I0G3 518 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 TMEM139Q8IV31 216 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 SLC30A5Q8TAD4 765 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 HDAC7Q8WUI4 952 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 TFAP2BQ92481 460 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 EDAQ92838 391 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 PBXIP1Q96AQ6 731 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 TRIM11Q96F44 468 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 SMARCD1Q96GM5 515 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 PCED1BQ96HM7 432 aa12.38□□□□□ -0.43
NISCH-211ENST00000488243 VCPIP1Q96JH7 1222 aa12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms