RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486404.5

CHMP3-208, Transcript of charged multivesicular body protein 3, human

TSL 3

Gene CHMP3, Length 650 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHMP3-208	ENST00000486404	BCO2	Q9BYV7	579 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	EHD2	Q9NZN4	543 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	CACNA1H	O95180	2353 aa		13.74	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	NCAN	O14594	1321 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	MAN2B1	O00754	1011 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	PSMA7	O14818	248 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	STX10	O60499	249 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	VNN1	O95497	513 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	HLA-DRA	P01903	254 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	PRCP	P42785	496 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	SV2A	Q7L0J3	742 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	OBP2A	Q9NY56	170 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	PCDHA5	Q9Y5H7	936 aa		13.73	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404		F8VP50	259 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	CHAD	O15335	359 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	NCAM2	O15394	837 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	CKM	P06732	381 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	CD72	P21854	359 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	MAGEA9	P43362	315 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	MXI1	P50539	228 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	CDH8	P55286	799 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	PLCB2	Q00722	1185 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	LRRC63	Q05C16	580 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	ENPEP	Q07075	957 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	ANGPT1	Q15389	498 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	TXNDC8	Q6A555	127 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	TTC16	Q8NEE8	873 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	MSANTD3	Q96H12	275 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	SPATA17	Q96L03	361 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	MYRFL	Q96LU7	910 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	KRT82	Q9NSB4	513 aa		13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	FAM170B	A6NMN3	283 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	TADA3	O75528	432 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	F11	P03951	625 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	WEE1	P30291	646 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	GTF2H1	P32780	548 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	PPP1R2	P41236	205 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	ASPA	P45381	313 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	PDE6C	P51160	858 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	KRT39	Q6A163	491 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	FAM35A	Q86V20	835 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	MON1A	Q86VX9	555 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	C8orf48	Q96LL4	319 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	NELL2	Q99435	816 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	TRPV5	Q9NQA5	729 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	SPATA6	Q9NWH7	488 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	NME7	Q9Y5B8	376 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	PIEZO1	Q92508	2521 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CHMP3-208	ENST00000486404	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CHMP3-208	ENST00000486404	SOBP	A7XYQ1	873 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CHMP3-208	ENST00000486404	LRRN2	O75325	713 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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