RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476646.5

NFIA-209, Transcript of nuclear factor I A, human

TSL 3

Gene NFIA, Length 730 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFIA-209	ENST00000476646	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	LMO3	Q8TAP4	145 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	TRAF3IP1	Q8TDR0	691 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	BSND	Q8WZ55	320 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	KCNN1	Q92952	543 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	SNF8	Q96H20	258 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	WNK4	Q96J92	1243 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	ZIM3	Q96PE6	472 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	GPR20	Q99678	358 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	COL25A1	Q9BXS0	654 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	CYP3A43	Q9HB55	503 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	OSGEP	Q9NPF4	335 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	EHD2	Q9NZN4	543 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	BTBD7	Q9P203	1132 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	IGKV6D-21	A0A0A0MT36	114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646		H0YHG0	523 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646		H3BQF6	201 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	NDUFAB1	O14561	156 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	TOMM70	O94826	608 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	KRT1	P04264	644 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	PGK2	P07205	417 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	PAEP	P09466	180 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	VSIG8	P0DPA2	414 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	EDNRB	P24530	442 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	ADSS	P30520	456 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	PHB	P35232	272 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	HSD17B3	P37058	310 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	SOX10	P56693	466 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	RBP5	P82980	135 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	POU5F1B	Q06416	359 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	MCL1	Q07820	350 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	PTP4A2	Q12974	167 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	PLCB4	Q15147	1175 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	CCL15	Q16663	113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	DGKD	Q16760	1214 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	SYT9	Q86SS6	491 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	ZNF410	Q86VK4	478 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	JAML	Q86YT9	394 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	MAP7D3	Q8IWC1	876 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	CNPY4	Q8N129	248 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	BEST2	Q8NFU1	509 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	EXD1	Q8NHP7	514 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	P3H4	Q92791	437 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	SEMA4D	Q92854	862 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	HAUS1	Q96CS2	278 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	TTC25	Q96NG3	672 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	ACAP3	Q96P50	834 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NFIA-209	ENST00000476646	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		4.97	□□□□□ -1.61

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