RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 ASPAP45381 313 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 CLCN5P51795 746 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 TEAD2Q15562 447 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 MDH1BQ5I0G3 518 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 FAM78AQ5JUQ0 283 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 SCN4BQ8IWT1 228 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 GIPC2Q8TF65 315 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 DNASE1L2Q92874 299 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 IRF7Q92985 503 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 SLC35C1Q96A29 364 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 EEF2KMTQ96G04 330 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP14.2□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 NT5C1AQ9BXI3 368 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 SMYD3Q9H7B4 428 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 MMRN2Q9H8L6 949 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 TRPV5Q9NQA5 729 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 LMBRD1Q9NUN5 540 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 COMMD8Q9NX08 183 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 CTNND2Q9UQB3 1225 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 USP34Q70CQ2 3546 aa14.2□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 SLC38A8A6NNN8 435 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 F11P03951 625 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 AVPR1AP37288 418 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 NDST1P52848 882 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 CDH8P55286 799 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 NLRP12P59046 1061 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 PRKCQQ04759 706 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 DDR2Q16832 855 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 GPR158Q5T848 1215 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 SMYD5Q6GMV2 418 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 C1orf228Q6PIY5 440 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 MFSD6LQ8IWD5 586 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 SMARCD1Q96GM5 515 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 PHOX2BQ99453 314 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 KXD1Q9BQD3 176 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 KIF9Q9HAQ2 790 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 IL21Q9HBE4 155 aa14.19□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 HCRTO43612 131 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 MBD3O95983 291 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 CFHP08603 1231 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 GLULP15104 373 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 RFX1P22670 979 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 FMO5P49326 533 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 GPC5P78333 572 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 TANGO2Q6ICL3 276 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 MON1AQ86VX9 555 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 YAF2Q8IY57 180 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 PDZD8Q8NEN9 1154 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 OVCA2Q8WZ82 227 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 SLITRK1Q96PX8 696 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 NELL2Q99435 816 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 MED10Q9BTT4 135 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 TTLL2Q9BWV7 592 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 ARHGEF3Q9NR81 526 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP14.18□□□□□ -0.142e-47■□□□□ 9.6
PRAME-211ENST00000476336 OBSL1O75147 1896 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 MYH10P35580 1976 aa14.18□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 F8VP50 259 aa14.17□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 NARSO43776 548 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 CILPO75339 1184 aa14.17□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 GJA1P17302 382 aa14.17□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 FCARP24071 287 aa14.17□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 RAP1GAPP47736 663 aa14.17□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 PLCB2Q00722 1185 aa14.17□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 FCHO2Q0JRZ9 810 aa14.17□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 CBWD6Q4V339 395 aa14.17□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa14.17□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 CBWD3Q5JTY5 395 aa14.17□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 CBWD5Q5RIA9 395 aa14.17□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 SPOPLQ6IQ16 392 aa14.17□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 ACOT1Q86TX2 421 aa14.17□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 FAM114A1Q8IWE2 563 aa14.17□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 TRIM59Q8IWR1 403 aa14.17□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 CMTM8Q8IZV2 173 aa14.17□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 SIX5Q8N196 739 aa14.17□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 NUP93Q8N1F7 819 aa14.17□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 GPR152Q8TDT2 470 aa14.17□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 MSANTD3Q96H12 275 aa14.17□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 FAM81BQ96LP2 452 aa14.17□□□□□ -0.14
PRAME-211ENST00000476336 ZSWIM3Q96MP5 696 aa14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.6 ms