RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRCPP42785 496 aa20.1■□□□□ 0.81
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TRAPPC10-208ENST00000469521 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 UBXN2BQ14CS0 331 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF852Q6ZMS4 543 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 MSANTD3Q96H12 275 aa20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC46A2Q9BY10 475 aa20.1■□□□□ 0.81
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TRAPPC10-208ENST00000469521 TRIM49CP0CI26 452 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 GLULP15104 373 aa20.09■□□□□ 0.81
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TRAPPC10-208ENST00000469521 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa20.09■□□□□ 0.81
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TRAPPC10-208ENST00000469521 KIF9Q9HAQ2 790 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 EHD2Q9NZN4 543 aa20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 PIEZO1Q92508 2521 aa20.09■□□□□ 0.81
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TRAPPC10-208ENST00000469521 PLCB2Q00722 1185 aa20.08■□□□□ 0.81
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TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 C1orf228Q6PIY5 440 aa20.08■□□□□ 0.81
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TRAPPC10-208ENST00000469521 MAB21L3Q8N8X9 362 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 BPIFB1Q8TDL5 484 aa20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa20.08■□□□□ 0.81
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TRAPPC10-208ENST00000469521 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
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TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM86C1Q9NVL1 165 aa20.07■□□□□ 0.8
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TRAPPC10-208ENST00000469521 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC10-208ENST00000469521 CLDN23Q96B33 292 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC10-208ENST00000469521 ELMO3Q96BJ8 720 aa20.06■□□□□ 0.8
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TRAPPC10-208ENST00000469521 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC10-208ENST00000469521 VPS13AQ96RL7 3174 aa20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC10-208ENST00000469521 PSMA7O14818 248 aa20.05■□□□□ 0.8
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TRAPPC10-208ENST00000469521 PPP1R2P41236 205 aa20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC10-208ENST00000469521 PDE6CP51160 858 aa20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC10-208ENST00000469521 CACNA2D1P54289 1103 aa20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC10-208ENST00000469521 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC10-208ENST00000469521 INCA1Q0VD86 236 aa20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC10-208ENST00000469521 STIM1Q13586 685 aa20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRT39Q6A163 491 aa20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM35AQ86V20 835 aa20.05■□□□□ 0.8
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