RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468807.1

TTC28-204, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-204ENST00000468807 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa23.27■■□□□ 1.32
TTC28-204ENST00000468807 TADA3O75528 432 aa23.27■■□□□ 1.32
TTC28-204ENST00000468807 CKMP06732 381 aa23.27■■□□□ 1.32
TTC28-204ENST00000468807 CMA1P23946 247 aa23.27■■□□□ 1.32
TTC28-204ENST00000468807 ANXA13P27216 316 aa23.27■■□□□ 1.32
TTC28-204ENST00000468807 MAGEA11P43364 429 aa23.27■■□□□ 1.32
TTC28-204ENST00000468807 CXCL12P48061 93 aa23.27■■□□□ 1.32
TTC28-204ENST00000468807 MYL6P60660 151 aa23.27■■□□□ 1.32
TTC28-204ENST00000468807 DCLK2Q8N568 766 aa23.27■■□□□ 1.32
TTC28-204ENST00000468807 KIAA0895Q8NCT3 520 aa23.27■■□□□ 1.32
TTC28-204ENST00000468807 ZNF516Q92618 1163 aa23.27■■□□□ 1.32
TTC28-204ENST00000468807 MYRFLQ96LU7 910 aa23.27■■□□□ 1.32
TTC28-204ENST00000468807 NCDNQ9UBB6 729 aa23.27■■□□□ 1.32
TTC28-204ENST00000468807 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa23.26■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 NRLP54845 237 aa23.26■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 SATB1Q01826 763 aa23.26■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 DGKKQ5KSL6 1271 aa23.26■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 VSTM1Q6UX27 236 aa23.26■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 Q6ZS52 159 aa23.26■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 FSIP1Q8NA03 581 aa23.26■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 SUMF1Q8NBK3 374 aa23.26■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 ZBTB44Q8NCP5 570 aa23.26■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 PCED1BQ96HM7 432 aa23.26■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 CYP2S1Q96SQ9 504 aa23.26■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 GPR179Q6PRD1 2367 aa23.25■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 PSMD2Q13200 908 aa23.25■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 RUNX3Q13761 415 aa23.25■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 GAS6Q14393 721 aa23.25■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa23.25■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 FAM83CQ9BQN1 747 aa23.25■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 DPEP3Q9H4B8 488 aa23.25■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 USP25Q9UHP3 1055 aa23.25■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 ZDHHC9Q9Y397 364 aa23.25■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 PTPRDP23468 1912 aa23.25■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 GREB1Q4ZG55 1949 aa23.25■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 SOBPA7XYQ1 873 aa23.24■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 A8MXQ7 604 aa23.24■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 TACC1O75410 805 aa23.24■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 USP17L7P0C7H9 530 aa23.24■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 SYKP43405 635 aa23.24■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 ID4P47928 161 aa23.24■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 KCNB1Q14721 858 aa23.24■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 WDR44Q5JSH3 913 aa23.24■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 SPEM1Q8N4L4 309 aa23.24■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 RIN3Q8TB24 985 aa23.24■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 PLEKHO2Q8TD55 490 aa23.24■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 NELL1Q92832 810 aa23.24■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 SPATA17Q96L03 361 aa23.24■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 SLC22A12Q96S37 553 aa23.24■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 HPS4Q9NQG7 708 aa23.24■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 NME7Q9Y5B8 376 aa23.24■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa23.23■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 DCHS1Q96JQ0 3298 aa23.23■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 C2orf78A6NCI8 922 aa23.23■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 TRIM66O15016 1216 aa23.23■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 RPN1P04843 607 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 TDGF1P13385 188 aa23.23■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 ARSAP15289 507 aa23.23■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 ATICP31939 592 aa23.23■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 FAM160A1Q05DH4 1040 aa23.23■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 MTF1Q14872 753 aa23.23■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 ZNF699Q32M78 642 aa23.23■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa23.23■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa23.23■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 EPC1Q9H2F5 836 aa23.23■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 SMYD3Q9H7B4 428 aa23.23■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 HPSEQ9Y251 543 aa23.23■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 F8VP50 259 aa23.22■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 LILRB5O75023 590 aa23.22■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 NR3C1P04150 777 aa23.22■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 RAP1GAPP47736 663 aa23.22■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 NDUFA8P51970 172 aa23.22■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 USP46P62068 366 aa23.22■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 NCOA4Q13772 614 aa23.22■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 PDGFRLQ15198 375 aa23.22■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 CEP135Q66GS9 1140 aa23.22■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 MAMSTRQ6ZN01 415 aa23.22■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 PARD3BQ8TEW8 1205 aa23.22■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 ELMO3Q96BJ8 720 aa23.22■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa23.22■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa23.22■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 STAU1O95793 577 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 ABL1P00519 1130 aa23.21■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 MYL1P05976 194 aa23.21■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 PRR29P0C7W0 189 aa23.21■■□□□ 1.31
TTC28-204ENST00000468807 HDCP19113 662 aa23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms