RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465122.5

PDCD6IP-208, Transcript of programmed cell death 6 interacting protein, human

TSL 3

Gene PDCD6IP, Length 894 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDCD6IP-208	ENST00000465122	USP1	O94782	785 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	IL33	O95760	270 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CBSL	P0DN79	551 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CBS	P35520	551 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	NR4A2	P43354	598 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	IGBP1	P78318	339 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	MTHFD1L	Q6UB35	978 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	WAC	Q9BTA9	647 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TNKS	O95271	1327 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122		H7C1Q1	480 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	UNC5C	O95185	931 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	GRP	P07492	148 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	IL1R2	P27930	398 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	MAP2K6	P52564	334 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ANAPC15	P60006	121 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SP2	Q02086	613 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PGS1	Q32NB8	556 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	AWAT2	Q6E213	333 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122		Q6ZWC4	215 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CUL5	Q93034	780 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	DSCR3	O14972	297 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	DCLK1	O15075	740 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PDE8B	O95263	885 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PRKCB	P05771	671 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SCP2	P22307	547 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	LRPAP1	P30533	357 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PDE6C	P51160	858 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SOX8	P57073	446 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	AMPD3	Q01432	767 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	LRRC41	Q15345	812 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	GPR162	Q16538	588 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TERB1	Q8NA31	727 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SLC35A4	Q96G79	324 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	TMX2	Q9Y320	296 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SOCS2	O14508	198 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	INSIG1	O15503	277 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	HDC	P19113	662 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	KRT17	Q04695	432 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PLS1	Q14651	629 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	FCRL6	Q6DN72	434 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	RITA1	Q96K30	269 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	XPR1	Q9UBH6	696 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122		H3BNC9	293 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	PSMD9	O00233	223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	GCAT	O75600	419 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	NTN1	O95631	604 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	FGB	P02675	491 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	POU2F2	P09086	479 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	CYP2C9	P11712	490 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	VCAM1	P19320	739 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	VIPR2	P41587	438 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	EVA1C	P58658	441 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	EMC10	Q5UCC4	262 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SHC4	Q6S5L8	630 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	KRT73	Q86Y46	540 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDCD6IP-208	ENST00000465122	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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