RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460639.2

ATRX-204, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 3

Gene ATRX, Length 461 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-204ENST00000460639 HSCBQ8IWL3 235 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 FUKQ8N0W3 1084 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 ARL10Q8N8L6 244 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 AFAP1L1Q8TED9 768 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 ZNF480Q8WV37 535 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 ATP6V1E2Q96A05 226 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 HIC2Q96JB3 615 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 ADPGKQ9BRR6 497 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 TWSG1Q9GZX9 223 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 EPC1Q9H2F5 836 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 ABCF3Q9NUQ8 709 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 IRAK4Q9NWZ3 460 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 OGDHLQ9ULD0 1010 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 ODF2LQ9ULJ1 636 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 SIK3Q9Y2K2 1263 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 ZNF711Q9Y462 761 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa5.13□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 TRIM64A6NGJ6 449 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 TRIM64BA6NI03 449 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 TTC36A6NLP5 189 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 PIP5K1BO14986 540 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 SLC16A6O15403 523 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 TMEM63AO94886 807 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 CLTBP09497 229 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 IDEP14735 1019 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 ALOX12P18054 663 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 TGM1P22735 817 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 ECHS1P30084 290 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 PTPN7P35236 360 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 SLC6A9P48067 706 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 CTSWP56202 376 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 PER3P56645 1201 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 VAMP2P63027 116 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 MST1LQ2TV78 715 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 CFAP58Q5T655 872 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 MFSD4BQ5TF39 518 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 FAM47EQ6ZV65 393 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 PPP1R3BQ86XI6 285 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 VSIG1Q86XK7 387 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 RHOT1Q8IXI2 618 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 CMTM4Q8IZR5 234 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 PQLC1Q8N2U9 271 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 GALNT4Q8N4A0 578 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 Q8NFD4 153 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 SCAMP5Q8TAC9 235 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 TCF25Q9BQ70 676 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 ITPAQ9BY32 194 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 TRPV4Q9HBA0 871 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 TM7SF3Q9NS93 570 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 GPRC5DQ9NZD1 345 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 TMOD4Q9NZQ9 345 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 LPAR3Q9UBY5 353 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 ZMYM3Q14202 1370 aa5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 CLCA1A8K7I4 914 aa5.11□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa5.11□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 CLGNO14967 610 aa5.11□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 MT-ND5P03915 603 aa5.11□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 TUBB4AP04350 444 aa5.11□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 BRAFP15056 766 aa5.11□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 GYPEP15421 78 aa5.11□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 RGS2P41220 211 aa5.11□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 CD86P42081 329 aa5.11□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 PPP5CP53041 499 aa5.11□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 FOXL1Q12952 345 aa5.11□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 SNAPC2Q13487 334 aa5.11□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 CUL4AQ13619 759 aa5.11□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 ICAM4Q14773 271 aa5.11□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 GRM7Q14831 915 aa5.11□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 GAGE13Q4V321 117 aa5.11□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 C19orf54Q5BKX5 351 aa5.11□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 SLC30A6Q6NXT4 461 aa5.11□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 USP49Q70CQ1 688 aa5.11□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa5.11□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa5.11□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 CHD1LQ86WJ1 897 aa5.11□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 TTC30AQ86WT1 665 aa5.11□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 XYLT1Q86Y38 959 aa5.11□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 C2CD5Q86YS7 1000 aa5.11□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 NGEFQ8N5V2 710 aa5.11□□□□□ -1.59
ATRX-204ENST00000460639 VGLL2Q8N8G2 317 aa5.11□□□□□ -1.59
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