RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 PKP1Q13835 747 aa9.06□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 LRRC32Q14392 662 aa9.06□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 GAB4Q2WGN9 574 aa9.06□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 DPH6Q7L8W6 267 aa9.06□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa9.06□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 WDR49Q8IV35 697 aa9.06□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCDC65Q8IXS2 484 aa9.06□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 SCFD1Q8WVM8 642 aa9.06□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYLPFQ96A32 169 aa9.06□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 DHX58Q96C10 678 aa9.06□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP9.06□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 GCNAQ96QF7 691 aa9.06□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYP2S1Q96SQ9 504 aa9.06□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 C7orf25Q9BPX7 421 aa9.06□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 SYT15Q9BQS2 421 aa9.06□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIF9Q9HAQ2 790 aa9.06□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa9.06□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 TDP1Q9NUW8 608 aa9.06□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZMYM5Q9UJ78 669 aa9.06□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 PTPRBP23467 1997 aa9.06□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 C2orf78A6NCI8 922 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF233A6NK53 670 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLIC2O15247 247 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 KLRC4O43908 158 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 CUTAO60888 179 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 TCF3P15923 654 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 WARSP23381 471 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 HOXA6P31267 233 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 GJA4P35212 333 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAGEA11P43364 429 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 LHX1P48742 406 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 NRLP54845 237 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 ASIC1P78348 528 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM160A1Q05DH4 1040 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 MTF1Q14872 753 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 BMT2Q1RMZ1 405 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 EML3Q32P44 896 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM26FQ5R3K3 315 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 LAIR1Q6GTX8 287 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 UNC13DQ70J99 1090 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 LONP2Q86WA8 852 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 SYNPOQ8N3V7 929 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 SNX21Q969T3 373 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCED1BQ96HM7 432 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 HPDLQ96IR7 371 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 CGRRF1Q99675 332 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 TTLL2Q9BWV7 592 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 XYLT2Q9H1B5 865 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 BLZF1Q9H2G9 400 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 CUEDC2Q9H467 287 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 WNT6Q9Y6F9 365 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBE4BO95155 1302 aa9.05□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 RNF40O75150 1001 aa9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 TACC1O75410 805 aa9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 OLFM2O95897 454 aa9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 F13A1P00488 732 aa9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 RETP07949 1114 aa9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 BDNFP23560 247 aa9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 PCSK1P29120 753 aa9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 AVPR1AP37288 418 aa9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 GALK1P51570 392 aa9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 CYP24A1Q07973 514 aa9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 CUL4BQ13620 913 aa9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 PSMD6Q15008 389 aa9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 SURF1Q15526 300 aa9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 TAF12Q16514 161 aa9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 RESP18Q5W5W9 173 aa9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRR23BQ6ZRT6 265 aa9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 WDR5BQ86VZ2 330 aa9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 SCN4BQ8IWT1 228 aa9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 NELFCDQ8IXH7 590 aa9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 C12orf56Q8IXR9 622 aa9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 RDH13Q8NBN7 331 aa9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIAA0895Q8NCT3 520 aa9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 ELMO3Q96BJ8 720 aa9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPATA17Q96L03 361 aa9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 DPEP3Q9H4B8 488 aa9.04□□□□□ -0.96
GAPDHP28-201ENST00000455134 ECT2Q9H8V3 914 aa9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms