RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C16orf87Q6PH81 154 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPATC1Q76KD6 591 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CYFIP1Q7L576 1253 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HDXQ7Z353 690 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SRLQ86TD4 932 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CABP7Q86V35 215 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TPH2Q8IWU9 490 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC39A11Q8N1S5 342 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LSMEM1Q8N8F7 131 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KCT2Q8NC54 265 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ACRBPQ8NEB7 543 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARHGAP45Q92619 1136 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF558Q96NG5 402 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM47Q9BQJ4 181 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZBP1Q9H171 429 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF287Q9HBT7 754 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RCAN3Q9UKA8 241 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRHDEQ9UKU6 1024 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CORINQ9Y5Q5 1042 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRPV2Q9Y5S1 764 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NUMBLQ9Y6R0 609 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MYO18BQ8IUG5 2567 aa6.21□□□□□ -1.41
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ABCB11O95342 1321 aa6.21□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa6.21□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NOTCH4Q99466 2003 aa6.21□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 A0A1W2PQH9 124 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KANSL1LA0AUZ9 987 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRIM64A6NGJ6 449 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRIM64BA6NI03 449 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GABRDO14764 452 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 INMTO95050 263 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HTR3BO95264 441 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KCNK5O95279 499 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CFBP00751 764 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RAC1P63000 192 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PGM5Q15124 567 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CSRP2Q16527 193 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAAH2Q6GMR7 532 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PLBD1Q6P4A8 553 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C19orf48Q6RUI8 117 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM151AQ8N4L1 468 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DTWD1Q8N5C7 304 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CCT6BQ92526 530 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CASD1Q96PB1 797 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TM9SF2Q99805 663 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ADAM2Q99965 735 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 VN1R3Q9BXE9 311 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 USP26Q9BXU7 913 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LTB4R2Q9NPC1 389 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MAN1C1Q9NR34 630 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HELLSQ9NRZ9 838 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPG21Q9NZD8 308 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CLUHO75153 1309 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 F5P12259 2224 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SHROOM3Q8TF72 1996 aa6.2□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM170BA6NMN3 283 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FOXP2O15409 715 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KIF5CO60282 957 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TLR5O60602 858 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LRP3O75074 770 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CXCL14O95715 111 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RETP07949 1114 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ATP5JP18859 108 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GALNSP34059 522 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PPM1AP35813 382 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRT20P35900 424 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HSD17B4P51659 736 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GPC5P78333 572 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRT17Q04695 432 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MTAPQ13126 283 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GALEQ14376 348 aa6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms