RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430889.2

HOXC4-202, Transcript of homeobox C4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC4, Length 1,666 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4-202ENST00000430889 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 DARSP14868 501 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 CHN1P15882 459 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 STILQ15468 1287 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 KYNUQ16719 465 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 HADHQ16836 314 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 C6orf89Q6UWU4 347 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 EXOC3L1Q86VI1 746 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 USP6NLQ92738 828 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 PEBP4Q96S96 227 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 NT5C1AQ9BXI3 368 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 CNTN3Q9P232 1028 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 TSPAN16Q9UKR8 245 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 DPYSL4O14531 572 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 CD48P09326 243 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 ETS1P14921 441 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 DRD4P21917 467 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 MIPP30301 263 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 SLCO1A2P46721 670 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 MORF4L2Q15014 288 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 LONRF1Q17RB8 773 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 SMTNL2Q2TAL5 461 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 LRRC52Q8N7C0 313 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 UBA3Q8TBC4 463 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 ZWILCHQ9H900 591 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 SNTG2Q9NY99 539 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 FLRT1Q9NZU1 646 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 ZNF148Q9UQR1 794 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 FAM169AQ9Y6X4 670 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 SMIM23A6NLE4 172 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 GABBR2O75899 941 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 MYO1EQ12965 1108 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 MAP2K5Q13163 448 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 QPCTQ16769 361 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 SKIDA1Q1XH10 827 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 XKR4Q5GH76 650 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 OLFML2BQ68BL8 750 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 NOTUMQ6P988 496 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 CEP128Q6ZU80 1094 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 GSTA5Q7RTV2 222 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 LIMS2Q7Z4I7 341 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 TTC30AQ86WT1 665 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 TTC13Q8NBP0 860 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 ACTL9Q8TC94 416 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 CNPY3Q9BT09 278 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 SLC4A5Q9BY07 1137 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 PHACTR1Q9C0D0 580 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 USP18Q9UMW8 372 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 SHOC2Q9UQ13 582 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 E5RJQ4 531 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 SETSIPP0DME0 302 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 AXLP30530 894 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 HOXC8P31273 242 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 MAGEA4P43358 317 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 TAF5Q15542 800 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 KCNT1Q5JUK3 1230 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 ARHGAP17Q68EM7 881 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 OLFML1Q6UWY5 402 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 VSTM1Q6UX27 236 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 CATSPER4Q7RTX7 472 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 C2orf69Q8N8R5 385 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 HAUS1Q96CS2 278 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 OSMRQ99650 979 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 TMEM121Q9BTD3 319 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 MIS12Q9H081 205 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 FAM107BQ9H098 131 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 SYNCQ9H7C4 482 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC4-202ENST00000430889 ASNSD1Q9NWL6 643 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms