RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NFATC1O95644 943 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP9.38□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MESP2Q0VG99 397 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF77Q15935 545 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CTXN3Q4LDR2 81 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CPB2Q96IY4 423 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CRISPLD1Q9H336 500 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RUBCNLQ9H714 662 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRIM27P14373 513 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ABCB4P21439 1286 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CYP4F2P78329 520 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KLRB1Q12918 225 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SHBQ15464 509 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KCNT1Q5JUK3 1230 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 VPS53Q5VIR6 699 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MYMKA6NI61 221 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CYP26A1O43174 497 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CPB1P15086 417 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TNFSF9P41273 254 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GRIA2P42262 883 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MTERF2Q49AM1 385 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC184Q52MB2 194 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF280DQ6N043 979 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TAOK1Q7L7X3 1001 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NIPA1Q7RTP0 329 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAB21L3Q8N8X9 362 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C3orf58Q8NDZ4 430 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MRGPRX1Q96LB2 322 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PSTPIP2Q9H939 334 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TM9SF3Q9HD45 589 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TNNQ9UQP3 1299 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIF26BQ2KJY2 2108 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SHANK1Q9Y566 2161 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NEDD4P46934 1319 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 YKT6O15498 198 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FGAP02671 866 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC6A4P31645 630 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CLCNKBP51801 687 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DUSP4Q13115 394 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UBE2SQ16763 222 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UPP1Q16831 310 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARL14Q8N4G2 192 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GRAMD1AQ96CP6 724 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TCTN2Q96GX1 697 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BCL11AQ9H165 835 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PCED1AQ9H1Q7 454 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WDR70Q9NW82 654 aa9.36□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ACANP16112 2415 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HEATR9A2RTY3 570 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OPA1O60313 960 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NTSR1P30989 418 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC6A11P48066 632 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM160A1Q05DH4 1040 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ORC1Q13415 861 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TBC1D10CQ8IV04 446 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UROC1Q96N76 676 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TBC1D22BQ9NU19 505 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM200CA6NKL6 621 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NPTXRO95502 500 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC27A1Q6PCB7 646 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LAYNQ6UX15 382 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC6A17Q9H1V8 727 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LINC00597Q9H2U6 94 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ITM2CQ9NQX7 267 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARHGEF4Q9NR80 690 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MYOFQ9NZM1 2061 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRAK2O60296 914 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TSPAN3O60637 253 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OXTRP30559 389 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HAND2P61296 217 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TGIF1Q15583 401 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 UGCGQ16739 394 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ISXQ2M1V0 245 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SFMBT2Q5VUG0 894 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms