RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 IL15P40933 162 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 MEOX1P50221 254 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 TIMM10P62072 90 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 COASYQ13057 564 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 GRM7Q14831 915 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 NFRKBQ6P4R8 1299 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 ATG9AQ7Z3C6 839 aa7.3□□□□□ -1.24
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PTPRK-211ENST00000429595 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 CPXCR1Q8N123 301 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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PTPRK-211ENST00000429595 TMEM176AQ96HP8 235 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 MSLNLQ96KJ4 702 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 RTP3Q9BQQ7 232 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 NELFAQ9H3P2 528 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 MMRN2Q9H8L6 949 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 HMG20BQ9P0W2 317 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 CHD6Q8TD26 2715 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 C5orf42Q9H799 3197 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 SCDO00767 359 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 GSTA4O15217 222 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 SLC26A4O43511 780 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 KPNA6O60684 536 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 ZBED4O75132 1171 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 PURAQ00577 322 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 SLFN5Q08AF3 891 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 GRAMD4Q6IC98 578 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.249e-8■□□□□ 8.3
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC105Q8IYK2 499 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 EFHBQ8N7U6 833 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 VCPKMTQ9H867 229 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 TMX2Q9Y320 296 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 RAD50Q92878 1312 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 GRM6O15303 877 aa7.28□□□□□ -1.24
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PTPRK-211ENST00000429595 SRGAP2BP0DMP2 458 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 NAT1P18440 290 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 SP100P23497 879 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 BMPR1AP36894 532 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM179Q6ZVK1 233 aa7.28□□□□□ -1.24
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PTPRK-211ENST00000429595 CERS3Q8IU89 383 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 HOMEZQ8IX15 550 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 CKAP2LQ8IYA6 745 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 D2HGDHQ8N465 521 aa7.28□□□□□ -1.24
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PTPRK-211ENST00000429595 GBP4Q96PP9 640 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 DHRS4Q9BTZ2 278 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC113Q9H0I3 377 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 FBXO28Q9NVF7 368 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 COQ6Q9Y2Z9 468 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 NBNO60934 754 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 AOC1P19801 751 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 TGM1P22735 817 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 GUCY1A2P33402 732 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 NRIP1P48552 1158 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 INHBCP55103 352 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 ICA1Q05084 483 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF627Q7L945 461 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 SGMS1Q86VZ5 419 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 OR6J1Q8NGC5 347 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 SLF1Q9BQI6 1058 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 PDGFCQ9NRA1 345 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 KCNH7Q9NS40 1196 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 EMSYQ7Z589 1322 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 ZFHX4Q86UP3 3567 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 A0A087X1B8 175 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 PMS2P1A4D2B8 440 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 CAPN14A8MX76 684 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 FOXP2O15409 715 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 KINO60870 393 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 STK10O94804 968 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 RASGRP1O95267 797 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 CKBP12277 381 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 SHMT1P34896 483 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PTPRK-211ENST00000429595 CNTN2Q02246 1040 aa7.26□□□□□ -1.25
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