RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429299.2

LTB-210, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-210ENST00000429299 BCKDHBP21953 392 aa20.86■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 ABCD1P33897 745 aa20.86■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 ANO7Q6IWH7 933 aa20.86■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 PLIN2Q99541 437 aa20.86■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 ABCB6Q9NP58 842 aa20.86■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 TMLHEQ9NVH6 421 aa20.86■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 LHX6Q9UPM6 363 aa20.86■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 PI4KAP42356 2102 aa20.86■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 TSC2P49815 1807 aa20.85■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 K7EQS6 105 aa20.85■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 SLC26A4O43511 780 aa20.85■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 NOL4O94818 638 aa20.85■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 CKMP06732 381 aa20.85■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 UBA7P41226 1012 aa20.85■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 GPR15P49685 360 aa20.85■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 ACOT2P49753 483 aa20.85■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 CRY1Q16526 586 aa20.85■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 DDR2Q16832 855 aa20.85■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 SV2CQ496J9 727 aa20.85■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 C2orf27AQ580R0 203 aa20.85■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 EFCAB13Q8IY85 973 aa20.85■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 MYCT1Q8N699 235 aa20.85■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 TTC16Q8NEE8 873 aa20.85■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa20.85■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 TRPC7Q9HCX4 862 aa20.85■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 MMP17Q9ULZ9 603 aa20.85■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 ZDHHC9Q9Y397 364 aa20.85■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 ITPR1Q14643 2758 aa20.84■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 TNFRSF10BO14763 440 aa20.84■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 SPTLC2O15270 562 aa20.84■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 TADA3O75528 432 aa20.84■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 ALDH1A2O94788 518 aa20.84■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 TCF3P15923 654 aa20.84■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 KRT85P78386 507 aa20.84■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 USP4Q13107 963 aa20.84■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 TRIM61Q5EBN2 209 aa20.84■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 SDHAF4Q5VUM1 108 aa20.84■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 SLFN12LQ6IEE8 588 aa20.84■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 SLC39A4Q6P5W5 647 aa20.84■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 LPCAT2Q7L5N7 544 aa20.84■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 FSIP1Q8NA03 581 aa20.84■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 LINC00301Q8NCQ3 95 aa20.84■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 MDGA1Q8NFP4 955 aa20.84■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 OLIG1Q8TAK6 271 aa20.84■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 SLC22A12Q96S37 553 aa20.84■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 ACBD6Q9BR61 282 aa20.84■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 LINC00597Q9H2U6 94 aa20.84■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 PARVGQ9HBI0 331 aa20.84■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 FREM2Q5SZK8 3169 aa20.83■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 UPK3BL1B0FP48 263 aa20.83■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 UPK3BL2E5RIL1 263 aa20.83■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 K7ENM7 598 aa20.83■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 TRAK2O60296 914 aa20.83■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 PPP6R2O75170 966 aa20.83■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 NFATC1O95644 943 aa20.83■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 CYP2F1P24903 491 aa20.83■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 RDXP35241 583 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 TXLNAP40222 546 aa20.83■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 PNPLA4P41247 253 aa20.83■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 DPP6P42658 865 aa20.83■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 ZNF131P52739 623 aa20.83■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 SPDYCQ5MJ68 293 aa20.83■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 ADALQ6DHV7 355 aa20.83■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 SYT12Q8IV01 421 aa20.83■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 STKLD1Q8NE28 680 aa20.83■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 SH3RF2Q8TEC5 729 aa20.83■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 CALML4Q96GE6 196 aa20.83■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 REEP2Q9BRK0 252 aa20.83■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 GCNT4Q9P109 453 aa20.83■□□□□ 0.93
LTB-210ENST00000429299 OBSL1O75147 1896 aa20.82■□□□□ 0.92
LTB-210ENST00000429299 MAP3K13O43283 966 aa20.82■□□□□ 0.92
LTB-210ENST00000429299 HDCP19113 662 aa20.82■□□□□ 0.92
LTB-210ENST00000429299 DDIT3P35638 169 aa20.82■□□□□ 0.92
LTB-210ENST00000429299 P2RY2P41231 377 aa20.82■□□□□ 0.92
LTB-210ENST00000429299 SEC13P55735 322 aa20.82■□□□□ 0.92
LTB-210ENST00000429299 GTF2BQ00403 316 aa20.82■□□□□ 0.92
LTB-210ENST00000429299 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
LTB-210ENST00000429299 TMEM119Q4V9L6 283 aa20.82■□□□□ 0.92
LTB-210ENST00000429299 KIAA1211LQ6NV74 962 aa20.82■□□□□ 0.92
LTB-210ENST00000429299 PIP4P1Q86T03 277 aa20.82■□□□□ 0.92
LTB-210ENST00000429299 NT5DC4Q86YG4 428 aa20.82■□□□□ 0.92
LTB-210ENST00000429299 CCDC33Q8N5R6 958 aa20.82■□□□□ 0.92
LTB-210ENST00000429299 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
LTB-210ENST00000429299 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.82■□□□□ 0.92
LTB-210ENST00000429299 ZNF560Q96MR9 790 aa20.82■□□□□ 0.92
LTB-210ENST00000429299 STYXL1Q9Y6J8 313 aa20.82■□□□□ 0.92
LTB-210ENST00000429299 MYO16Q9Y6X6 1858 aa20.81■□□□□ 0.92
LTB-210ENST00000429299 FAM221BA6H8Z2 402 aa20.81■□□□□ 0.92
LTB-210ENST00000429299 H0Y626 953 aa20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms