RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424766.5

PMS1-211, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 3

Gene PMS1, Length 831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-211ENST00000424766 FAM50BQ9Y247 325 aa21.87■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 NOTCH4Q99466 2003 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 GRXCR2A6NFK2 248 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 TRIM66O15016 1216 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 CBFA2T2O43439 604 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 SOAT2O75908 522 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 TPM3P06753 285 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 CD19P15391 556 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 ATF6P18850 670 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 RAPGEF1Q13905 1077 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 VEPH1Q14D04 833 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 FAM71AQ8IYT1 594 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 NECTIN4Q96NY8 510 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa21.86■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 EPHB6O15197 1021 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 AP1G2O75843 785 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 ANXA13P27216 316 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 ADORA2BP29275 332 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 USP8P40818 1118 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 BPIFB4P59827 614 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 STILQ15468 1287 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 CNGA2Q16280 664 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 DDR2Q16832 855 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 PSMG2Q969U7 264 aa21.85■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 FAM200BP0CF97 657 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 CSH1P0DML2 217 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 CSH2P0DML3 217 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 PBX1P40424 430 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 GPR15P49685 360 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 PTK2Q05397 1052 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 ANKRD52Q8NB46 1076 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 LEMD2Q8NC56 503 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 FEZF2Q8TBJ5 459 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 GIPC2Q8TF65 315 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 TFAP2BQ92481 460 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 SMOQ99835 787 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 DUSP16Q9BY84 665 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 GPR88Q9GZN0 384 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 NLRC4Q9NPP4 1024 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 KRT82Q9NSB4 513 aa21.84■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 F8VP50 259 aa21.83■■□□□ 1.09
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PMS1-211ENST00000424766 CYP26A1O43174 497 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 CLCN1P35523 988 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 CACNA2D1P54289 1103 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 EPHA5P54756 1037 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 JAM2P57087 298 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
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PMS1-211ENST00000424766 LCLAT1Q6UWP7 414 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 SPAG5Q96R06 1193 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 KCNK16Q96T55 309 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 NUP58Q9BVL2 599 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 EDEM3Q9BZQ6 932 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 UBXN6Q9BZV1 441 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 TMEM30AQ9NV96 361 aa21.83■■□□□ 1.09
PMS1-211ENST00000424766 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa21.83■■□□□ 1.09
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PMS1-211ENST00000424766 DENND4AQ7Z401 1863 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-211ENST00000424766 SLC38A8A6NNN8 435 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-211ENST00000424766 F8VZ95 297 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-211ENST00000424766 MED7O43513 233 aa21.82■■□□□ 1.08
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PMS1-211ENST00000424766 SDHAF4Q5VUM1 108 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-211ENST00000424766 CLEC20AQ6ZU45 233 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-211ENST00000424766 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-211ENST00000424766 ZMIZ2Q8NF64 920 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-211ENST00000424766 GPR152Q8TDT2 470 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-211ENST00000424766 ZNF606Q8WXB4 792 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-211ENST00000424766 ASB2Q96Q27 587 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-211ENST00000424766 ZSWIM1Q9BR11 485 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-211ENST00000424766 CORO1BQ9BR76 489 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-211ENST00000424766 LRRC3Q9BY71 257 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-211ENST00000424766 CDH22Q9UJ99 828 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-211ENST00000424766 TSPAN16Q9UKR8 245 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-211ENST00000424766 MYO6Q9UM54 1294 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-211ENST00000424766 DENND4CQ5VZ89 1909 aa21.82■■□□□ 1.08
PMS1-211ENST00000424766 PATJQ8NI35 1801 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-211ENST00000424766 ZNF197O14709 1029 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-211ENST00000424766 BEST1O76090 585 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-211ENST00000424766 FGF19O95750 216 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-211ENST00000424766 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PMS1-211ENST00000424766 NPR3P17342 541 aa21.81■■□□□ 1.08
PMS1-211ENST00000424766 GNA15P30679 374 aa21.81■■□□□ 1.08
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