RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416748.1

NUP35P2-201, Transcript of nucleoporin 35 pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene NUP35P2, Length 943 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35P2-201ENST00000416748 RAB39AQ14964 217 aa4.82□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 TAF11Q15544 211 aa4.82□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 RAB30Q15771 203 aa4.82□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa4.82□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 ANKRD45Q5TZF3 282 aa4.82□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 FAM205BPQ63HN1 556 aa4.82□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 SULT6B1Q6IMI4 303 aa4.82□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 FAM180AQ6UWF9 173 aa4.82□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 TSPYL6Q8N831 410 aa4.82□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 ANKRD52Q8NB46 1076 aa4.82□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 STYXQ8WUJ0 223 aa4.82□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 RUBCNQ92622 972 aa4.82□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 RILPL2Q969X0 211 aa4.82□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 C7orf26Q96N11 449 aa4.82□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 GDF15Q99988 308 aa4.82□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 DPH1Q9BZG8 443 aa4.82□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 TMEM8AQ9HCN3 771 aa4.82□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 NECTIN3Q9NQS3 549 aa4.82□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 SACM1LQ9NTJ5 587 aa4.82□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa4.82□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 FEM1BQ9UK73 627 aa4.82□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 PCDHA6Q9UN73 950 aa4.82□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 A0A0A6YYJ9 748 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 TOR1BO14657 336 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 TMEM127O75204 238 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 FAM155BO75949 473 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 MT-ND5P03915 603 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 MALP21145 153 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 CTGFP29279 349 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 ROR1Q01973 937 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 TLE1Q04724 770 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 MAPK7Q13164 816 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 KIF22Q14807 665 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 CREBRFQ8IUR6 639 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 HERC6Q8IVU3 1022 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 ZMIZ2Q8NF64 920 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 GPR156Q8NFN8 814 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 OR6B3Q8NGW1 331 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 IFI44Q8TCB0 444 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 CALML6Q8TD86 181 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 THAP4Q8WY91 577 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 RFFLQ8WZ73 363 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 MAML1Q92585 1016 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 EID2BQ96D98 161 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 HIST1H2AJQ99878 128 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 PDCD2LQ9BRP1 358 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 AGXT2Q9BYV1 514 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 MANSC1Q9H8J5 431 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 IGSF9Q9P2J2 1179 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 PACSIN3Q9UKS6 424 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa4.81□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 A0A1W2PPH5 198 aa4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 DAPK3O43293 454 aa4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 AHCYL1O43865 530 aa4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 NDST3O95803 873 aa4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 GLULP15104 373 aa4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 APEX1P27695 318 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 CST5P28325 142 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 SLC6A9P48067 706 aa4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 FLT3LGP49771 235 aa4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 UBE3AQ05086 875 aa4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 ADAM15Q13444 863 aa4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 EMC10Q5UCC4 262 aa4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 TMCO3Q6UWJ1 677 aa4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 ZNF783Q6ZMS7 281 aa4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 GADL1Q6ZQY3 521 aa4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 RSPH3Q86UC2 560 aa4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 PPP1R3BQ86XI6 285 aa4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 TCP11L2Q8N4U5 519 aa4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 TMX3Q96JJ7 454 aa4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 TIGD1Q96MW7 591 aa4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 SDF4Q9BRK5 362 aa4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 CCDC68Q9H2F9 335 aa4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 PREBQ9HCU5 417 aa4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 KCMF1Q9P0J7 381 aa4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa4.8□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa4.79□□□□□ -1.64
NUP35P2-201ENST00000416748 PIP5K1BO14986 540 aa4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.4 ms