RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391230.1

SNORD66.1-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 66, humanhuman

BASIC

Gene SNORD66, Length 76 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD66.1-201ENST00000391230 RAPGEF5Q92565 580 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 HSFY1Q96LI6 401 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 RTP3Q9BQQ7 232 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 BEGAINQ9BUH8 593 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 FUT8Q9BYC5 575 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 B3GNT5Q9BYG0 378 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 RAB6CQ9H0N0 254 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 RNF208Q9H0X6 261 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 SYNCQ9H7C4 482 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 EPB41L5Q9HCM4 733 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 ARFGAP3Q9NP61 516 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 UBN1Q9NPG3 1134 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 CRTAC1Q9NQ79 661 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 HESX1Q9UBX0 185 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 AMACRQ9UHK6 382 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 UTRNP46939 3433 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 SCN1AP35498 2009 aa4.55□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 ESYT3A0FGR9 886 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 C2CD4BA6NLJ0 364 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 F8W810 466 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 PI4K2BG5E9Z4 385 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 M0QZQ0 153 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 TTI1O43156 1089 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 PSTPIP1O43586 416 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 ERLIN1O75477 346 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 GRAP2O75791 330 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 B3GAT3O94766 335 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 ITGB1P05556 798 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 FAM153BP0C7A2 387 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 RALAP11233 206 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 KRT10P13645 584 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 LCP1P13796 627 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 PDGFRAP16234 1089 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 HSPA6P17066 643 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 GPD1P21695 349 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 MCM3P25205 808 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 TNFRSF8P28908 595 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 MIPP30301 263 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 GJC1P36383 396 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 FLT3P36888 993 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 COILP38432 576 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 PLA2G4AP47712 749 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 KCNJ1P48048 391 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 LHX1P48742 406 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 NDUFV1P49821 464 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 GATMP50440 423 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 TLE2Q04725 743 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 ADCY2Q08462 1091 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 DSC1Q08554 894 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 BST2Q10589 180 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 GRIK3Q13003 919 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 PPP2R5EQ16537 467 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 CYP1B1Q16678 543 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 FAM153CQ494X1 144 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 CCDC14Q49A88 953 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 MDH1BQ5I0G3 518 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 NOMO2Q5JPE7 1267 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 CLLU1OSQ5K130 101 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 SEL1L2Q5TEA6 688 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 C8orf74Q6P047 294 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 TTC27Q6P3X3 843 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 FAM171BQ6P995 826 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 OLFML1Q6UWY5 402 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 MAATS1Q7Z4T9 603 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 PIGZQ86VD9 579 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 LRRTM3Q86VH5 581 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 IFT20Q8IY31 132 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 COLGALT2Q8IYK4 626 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 KATNAL2Q8IYT4 538 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 TMEM86AQ8N2M4 240 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 EXD1Q8NHP7 514 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 CCDC26Q8TAB7 109 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 FNIP1Q8TF40 1166 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 CLEC4CQ8WTT0 213 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 IFT81Q8WYA0 676 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 RSPH1Q8WYR4 309 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 SEPT8Q92599 483 aa4.54□□□□□ -1.68
SNORD66.1-201ENST00000391230 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms