RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380817.7

SBF1-202, Transcript of SET binding factor 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBF1, Length 8,008 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBF1-202ENST00000380817 ANKS6Q68DC2 871 aa14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 BARGINQ6ZT62 677 aa14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 SLC40A1Q9NP59 571 aa14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 ADGRA2Q96PE1 1338 aa14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 RAD17O75943 681 aa14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 CD302Q8IX05 232 aa14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 SEPT1Q8WYJ6 367 aa14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 WDR24Q96S15 920 aa14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 SERHL2Q9H4I8 314 aa14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 SERHLQ9NQF3 203 aa14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 NEDD4P46934 1319 aa14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 TMEM114B3SHH9 223 aa14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 IL6P05231 212 aa14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 DENND1BQ6P3S1 775 aa14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 PACSIN1Q9BY11 444 aa14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 KLHL25Q9H0H3 589 aa14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 POLG2Q9UHN1 485 aa14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 F5H6K3 240 aa14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 SERPIND1P05546 499 aa14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 TGM2P21980 687 aa14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 SKP1P63208 163 aa14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 KLRC3Q07444 240 aa14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 ZNF507Q8TCN5 953 aa14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 CYP39A1Q9NYL5 469 aa14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 SLC24A2Q9UI40 661 aa14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa14.64□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 USP17L15C9J2P7 530 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 USP17L13C9JLJ4 530 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 USP17L11C9JVI0 530 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 USP17L18D6R9N7 530 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 USP17L22D6RA61 530 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 USP17L17D6RBQ6 530 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 USP17L19D6RCP7 530 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 USP17L20D6RJB6 530 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 VPS4BO75351 444 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 TNFAIP8O95379 198 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 IL12RB1P42701 662 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 STAT5BP51692 787 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 USP17L24Q0WX57 530 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 IL31Q6EBC2 164 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 USP17L6PQ6QN14 398 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 ULK2Q8IYT8 1036 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 ERGIC2Q96RQ1 377 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 PHACTR1Q9C0D0 580 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 WWOXQ9NZC7 414 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 VTI1BQ9UEU0 232 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 VAV3Q9UKW4 847 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 ASAP1Q9ULH1 1129 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 ASNA1O43681 348 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 SASH1O94885 1247 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 NQO1P15559 274 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 MAPK7Q13164 816 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 INAQ16352 499 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 PTGISQ16647 500 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 CYB5D1Q6P9G0 228 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 IFNEQ86WN2 208 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 ANKS1AQ92625 1134 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 RXFP1Q9HBX9 757 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 BCL10O95999 233 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 GLI2P10070 1586 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 SPANXN2Q5MJ10 180 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 ARMC4Q5T2S8 1044 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 SEC31BQ9NQW1 1179 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 MYH3P11055 1940 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 MYL4P12829 197 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 COX10Q12887 443 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 CCDC81Q6ZN84 652 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 EID3Q8N140 333 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 PPP1R36Q96LQ0 422 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 VTA1Q9NP79 307 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 FAM220BPB1ANY3 271 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 F9P00740 461 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 DPYDQ12882 1025 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 PMF1Q6P1K2 205 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 AGAP3Q96P47 875 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 WDR41Q9HAD4 459 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 RNF112Q9ULX5 631 aa14.63□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 RRN3P2A6NIE6 340 aa14.62□□□□□ -0.07
SBF1-202ENST00000380817 NBPF26B4DH59 902 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms