RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF135Q8IUD6 432 aa16.34■□□□□ 0.21
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PGGT1B-202ENST00000379615 WHAMMQ8TF30 809 aa16.34■□□□□ 0.21
PGGT1B-202ENST00000379615 CYFIP2Q96F07 1278 aa16.34■□□□□ 0.21
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PGGT1B-202ENST00000379615 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa16.33■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP16.33■□□□□ 0.2
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa16.32■□□□□ 0.2
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PGGT1B-202ENST00000379615 ATXN3LQ9H3M9 355 aa16.32■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 KRT82Q9NSB4 513 aa16.32■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 TAB2Q9NYJ8 693 aa16.32■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
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PGGT1B-202ENST00000379615 C5orf42Q9H799 3197 aa16.31■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1W2PRU2 124 aa16.31■□□□□ 0.2
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PGGT1B-202ENST00000379615 GPR37L1O60883 481 aa16.31■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
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PGGT1B-202ENST00000379615 MCRS1Q96EZ8 462 aa16.31■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 FUCA2Q9BTY2 467 aa16.31■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
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PGGT1B-202ENST00000379615 APEX2Q9UBZ4 518 aa16.31■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP16.31■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 DENND4AQ7Z401 1863 aa16.31■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 LRRC10BA6NIK2 292 aa16.3■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 ANHXE9PGG2 379 aa16.3■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 DCXO43602 365 aa16.3■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 CD19P15391 556 aa16.3■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF18P17022 549 aa16.3■□□□□ 0.2
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