RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376854.5

C9orf40-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf40, Length 2,327 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40-201ENST00000376854 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP26.54■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 ZWINTO95229 277 aa26.54■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 TNNC2P02585 160 aa26.54■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 THNSL1Q8IYQ7 743 aa26.54■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 FBXO36Q8NEA4 188 aa26.54■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 LHX5Q9H2C1 402 aa26.54■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 LRMDAQ9H2I8 198 aa26.54■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 PIAS1O75925 651 aa26.53■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 TARSP26639 723 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 RAP1GAPP47736 663 aa26.53■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 OSTNP61366 133 aa26.53■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 FNIP1Q8TF40 1166 aa26.53■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 C10orf82Q8WW14 230 aa26.53■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 SEPT1Q8WYJ6 367 aa26.53■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 PAFAH2Q99487 392 aa26.53■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa26.53■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 GPRC5DQ9NZD1 345 aa26.53■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 MED7O43513 233 aa26.53■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 USP2O75604 605 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 CD48P09326 243 aa26.53■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 FGFR1P11362 822 aa26.53■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 MARK3P27448 753 aa26.53■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 KLHL38Q2WGJ6 581 aa26.53■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 ADGRD1Q6QNK2 874 aa26.53■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 OTOAQ7RTW8 1153 aa26.53■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 LRRC71Q8N4P6 559 aa26.53■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 EMC1Q8N766 993 aa26.53■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa26.53■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 ACSS3Q9H6R3 686 aa26.53■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 MTM1Q13496 603 aa26.52■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 VGLL4Q14135 290 aa26.52■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 TAZQ16635 292 aa26.52■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 EEPD1Q7L9B9 569 aa26.52■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 KCTD6Q8NC69 237 aa26.52■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 DHRS4Q9BTZ2 278 aa26.52■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 SYNCQ9H7C4 482 aa26.52■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 HAO1Q9UJM8 370 aa26.52■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 WDR90Q96KV7 1748 aa26.52■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa26.51■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 RFX6Q8HWS3 928 aa26.51■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 UNC45BQ8IWX7 931 aa26.51■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 PALM2Q8IXS6 379 aa26.51■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 TMEM237Q96Q45 408 aa26.51■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 CPXM1Q96SM3 734 aa26.51■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 PCSK1NQ9UHG2 260 aa26.51■■□□□ 1.84
C9orf40-201ENST00000376854 SOWAHBA6NEL2 793 aa26.51■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 E7ESA3 106 aa26.51■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 PARP6Q2NL67 630 aa26.51■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 BBS9Q3SYG4 887 aa26.51■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 SH3D19Q5HYK7 790 aa26.51■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 FAM167AQ96KS9 214 aa26.51■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 LOC285556D6RIA3 1793 aa26.51■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 TMEM63AO94886 807 aa26.5■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 KRT19P08727 400 aa26.5■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 ADRA1DP25100 572 aa26.5■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 MPZL3Q6UWV2 235 aa26.5■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 LBX2Q6XYB7 198 aa26.5■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 XYLT1Q86Y38 959 aa26.5■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 FAM71DQ8N9W8 422 aa26.5■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 CYLDQ9NQC7 956 aa26.5■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 B4GALT4O60513 344 aa26.5■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 ERBB2P04626 1255 aa26.5■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 ORC1Q13415 861 aa26.5■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 METTL7BQ6UX53 244 aa26.5■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 PDIK1LQ8N165 341 aa26.5■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP26.5■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 PPME1Q9Y570 386 aa26.5■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 DIAPH2O60879 1101 aa26.49■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 WFS1O76024 890 aa26.49■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 EDNRBP24530 442 aa26.49■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 LY6KQ17RY6 165 aa26.49■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 CEP120Q8N960 986 aa26.49■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 MZB1Q8WU39 189 aa26.49■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 C2orf40Q9H1Z8 148 aa26.49■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 WDR35Q9P2L0 1181 aa26.49■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 WDR91A4D1P6 747 aa26.49■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 PROZP22891 400 aa26.49■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 RAD23BP54727 409 aa26.49■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 CDH8P55286 799 aa26.49■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 BASP1P80723 227 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 ATF7IP2Q5U623 682 aa26.49■■□□□ 1.83
C9orf40-201ENST00000376854 FYB2Q5VWT5 728 aa26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms