RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368213.9

PTPRK-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 5,816 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-205ENST00000368213 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP11.2□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 IFNL1Q8IU54 200 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 EDEM1Q92611 657 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 GRIN1Q05586 938 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 CRHR2Q13324 411 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 MTA1Q13330 715 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 DUSP28Q4G0W2 176 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP11.2□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 GAS2L3Q86XJ1 694 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 SPIRE2Q8WWL2 714 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 OSBPL9Q96SU4 736 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 MED4Q9NPJ6 270 aa11.2□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 ASGR1P07306 291 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 CCR1P32246 355 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 USP38Q8NB14 1042 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 SLC13A1Q9BZW2 595 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 PDGFCQ9NRA1 345 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 CD274Q9NZQ7 290 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 MAP10Q9P2G4 905 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 SEPT4O43236 478 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 CST8O60676 142 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 PARNO95453 639 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 SLURP2P0DP57 97 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 MAPK9P45984 424 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 GEMP55040 296 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 PKN3Q6P5Z2 889 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 TMEM86AQ8N2M4 240 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 LPPQ93052 612 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 SENP8Q96LD8 212 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 SPG21Q9NZD8 308 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 CTIFO43310 598 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 MAPTP10636 758 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 LAG3P18627 525 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 NDST1P52848 882 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 ANKS1AQ92625 1134 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 GRID2IPA4D2P6 1211 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 NFKBIEO00221 500 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 PPFIA2O75334 1257 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 GLUD1P00367 558 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 ANKMY2Q8IV38 441 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 ENGASEQ8NFI3 743 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 C11orf49Q9H6J7 331 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 RNF19AQ9NV58 838 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 PAK5Q9P286 719 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 MROH1Q8NDA8 1641 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 FAM187AA6NFU0 413 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 BDNFP23560 247 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 MTFR1Q15390 333 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 SLC45A4Q5BKX6 768 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 SPDYAQ5MJ70 313 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 ACAD10Q6JQN1 1059 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 TPGS1Q6ZTW0 290 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 FAM172AQ8WUF8 416 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 EFHD1Q9BUP0 239 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 INTS13Q9NVM9 706 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 L3MBTL1Q9Y468 752 aa11.19□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 TTLL9Q3SXZ7 439 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 LINC00523Q86TU6 105 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 PPTC7Q8NI37 304 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 APBB2Q92870 758 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 IL17RAQ96F46 866 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 USP20Q9Y2K6 914 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 CYP3A4P08684 503 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 PTGER2P43116 358 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 FSTL1Q12841 308 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 SPARCL1Q14515 664 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 USP10Q14694 798 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 PSMD5Q16401 504 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 FAM131BQ86XD5 332 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 LMNTD2Q8IXW0 634 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 TAS1R2Q8TE23 839 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 RWDD3Q9Y3V2 267 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 RHOBTB1O94844 696 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 GJB1P08034 283 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 ADIGQ0VDE8 80 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 ARID5BQ14865 1188 aa11.18□□□□□ -0.62
PTPRK-205ENST00000368213 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms