RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 PASD1Q8IV76 773 aa22.74■■□□□ 1.23
OPN3-201ENST00000366554 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
OPN3-201ENST00000366554 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.74■■□□□ 1.23
OPN3-201ENST00000366554 CLCN2P51788 898 aa22.73■■□□□ 1.23
OPN3-201ENST00000366554 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
OPN3-201ENST00000366554 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
OPN3-201ENST00000366554 GAD2Q05329 585 aa22.73■■□□□ 1.23
OPN3-201ENST00000366554 CDK18Q07002 472 aa22.73■■□□□ 1.23
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OPN3-201ENST00000366554 MTMR2Q13614 643 aa22.73■■□□□ 1.23
OPN3-201ENST00000366554 ADRM1Q16186 407 aa22.73■■□□□ 1.23
OPN3-201ENST00000366554 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
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OPN3-201ENST00000366554 HELQQ8TDG4 1101 aa22.73■■□□□ 1.23
OPN3-201ENST00000366554 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
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OPN3-201ENST00000366554 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa22.73■■□□□ 1.23
OPN3-201ENST00000366554 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.73■■□□□ 1.23
OPN3-201ENST00000366554 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa22.73■■□□□ 1.23
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OPN3-201ENST00000366554 DNAJA2O60884 412 aa22.73■■□□□ 1.23
OPN3-201ENST00000366554 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
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OPN3-201ENST00000366554 SEMA4DQ92854 862 aa22.73■■□□□ 1.23
OPN3-201ENST00000366554 ZNF696Q9H7X3 374 aa22.73■■□□□ 1.23
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OPN3-201ENST00000366554 BTKQ06187 659 aa22.72■■□□□ 1.23
OPN3-201ENST00000366554 BST1Q10588 318 aa22.72■■□□□ 1.23
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OPN3-201ENST00000366554 H3BNX3 289 aa22.72■■□□□ 1.23
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OPN3-201ENST00000366554 PORP16435 677 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
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OPN3-201ENST00000366554 USP41Q3LFD5 358 aa22.72■■□□□ 1.23
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OPN3-201ENST00000366554 Q6ZNX1 250 aa22.72■■□□□ 1.23
OPN3-201ENST00000366554 KCTD1Q719H9 257 aa22.72■■□□□ 1.23
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OPN3-201ENST00000366554 OASLQ15646 514 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
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OPN3-201ENST00000366554 RALGPS1Q5JS13 557 aa22.71■■□□□ 1.23
OPN3-201ENST00000366554 TMEM174Q8WUU8 243 aa22.71■■□□□ 1.23
OPN3-201ENST00000366554 ACAP3Q96P50 834 aa22.71■■□□□ 1.23
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OPN3-201ENST00000366554 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.71■■□□□ 1.23
OPN3-201ENST00000366554 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.71■■□□□ 1.23
OPN3-201ENST00000366554 I3L4J1 428 aa22.71■■□□□ 1.23
OPN3-201ENST00000366554 BIRC5O15392 142 aa22.71■■□□□ 1.23
OPN3-201ENST00000366554 ATP6V1B1P15313 513 aa22.71■■□□□ 1.23
OPN3-201ENST00000366554 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
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OPN3-201ENST00000366554 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa22.7■■□□□ 1.22
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OPN3-201ENST00000366554 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.7■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 CBWD1Q9BRT8 395 aa22.7■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 PCDH9Q9HC56 1237 aa22.7■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 TUFT1Q9NNX1 390 aa22.7■■□□□ 1.22
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OPN3-201ENST00000366554 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 YY1P25490 414 aa22.7■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 COG7P83436 770 aa22.7■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 MYBPC1Q00872 1141 aa22.7■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 PLCB3Q01970 1234 aa22.7■■□□□ 1.22
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OPN3-201ENST00000366554 GSTM4Q03013 218 aa22.7■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 C2CD6Q53TS8 623 aa22.7■■□□□ 1.22
OPN3-201ENST00000366554 KAZNQ674X7 775 aa22.7■■□□□ 1.22
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