RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364604.1

RNU6-164P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 164, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-164P, Length 103 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-164P-201ENST00000364604 ARNTP27540 789 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 HSPA4P34932 840 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 FLT3P36888 993 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 RBM25P49756 843 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 MEOX1P50221 254 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 PPOXP50336 477 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 CCT8P50990 548 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 TBX4P57082 545 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 ETF1P62495 437 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 PFKPQ01813 784 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 ID2Q02363 134 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 CFHR3Q02985 330 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 SREBF2Q12772 1141 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 NR1H3Q13133 447 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 UNC119Q13432 240 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 TDGQ13569 410 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 SLC39A14Q15043 492 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 E2F4Q16254 413 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 TAF9Q16594 264 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 PCOTHQ58A44 107 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 ARMC6Q6NXE6 501 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 CEP85Q6P2H3 762 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 VWA1Q6PCB0 445 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 ZNF613Q6PF04 617 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 VITQ6UXI7 678 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 CREB3L2Q70SY1 520 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 SLC26A9Q7LBE3 791 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 GRINAQ7Z429 371 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 ZNF804AQ7Z570 1209 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 EXOC3L1Q86VI1 746 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 PLD3Q8IV08 490 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 RTKN2Q8IZC4 609 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 RBFAQ8N0V3 343 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 TMEM199Q8N511 208 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 PRR26Q8N8Z3 221 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 ANKRD53Q8N9V6 530 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 PNMA1Q8ND90 353 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 NEK9Q8TD19 979 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 CHTF18Q8WVB6 975 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 PIK3R5Q8WYR1 880 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 SEC14L1Q92503 715 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 TAAR8Q969N4 342 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 ESAMQ96AP7 390 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 ELMO3Q96BJ8 720 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 RITA1Q96K30 269 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 ZDHHC15Q96MV8 337 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 NPAS1Q99742 590 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 ZNF649Q9BS31 505 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 SLC12A9Q9BXP2 914 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 EPB41L1Q9H4G0 881 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 TMEM74BQ9NUR3 256 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 NECAP2Q9NVZ3 263 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 PDP2Q9P2J9 529 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 ASIC3Q9UHC3 531 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 RASAL2Q9UJF2 1139 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 RAB23Q9ULC3 237 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 MXRA5Q9NR99 2828 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 FASNP49327 2511 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 CKAP5Q14008 2032 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 DLG5Q8TDM6 1919 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 PRAG1Q86YV5 1406 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 DNAH3Q8TD57 4116 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 DNAH6Q9C0G6 4158 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 AATKQ6ZMQ8 1374 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 RTTNQ86VV8 2226 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 COL12A1Q99715 3063 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 A0A0U1RQJ8 604 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 A0A0U1RQK1 487 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 A0A1B0GTW7 788 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 C2orf78A6NCI8 922 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 PMS2P5A8MQ11 134 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 GOLGA8BA8MQT2 603 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-164P-201ENST00000364604 DIRC3C9JPN6 131 aa-0.9□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms