RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPSB4Q96A44 273 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-227P-201ENST00000362865 PBKQ96KB5 322 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-227P-201ENST00000362865 MSLNLQ96KJ4 702 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-227P-201ENST00000362865 BTBD1Q9H0C5 482 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-227P-201ENST00000362865 NUP62CLQ9H1M0 184 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-227P-201ENST00000362865 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-227P-201ENST00000362865 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCDC151A5D8V7 595 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 URI1O94763 535 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 NR2F6P10588 404 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 JUPP14923 745 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 BMP5P22003 454 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 KLRC1P26715 233 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADORA2AP29274 412 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 LIPAP38571 399 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 CLCN2P51788 898 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 CACNA2D1P54289 1103 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRT17Q04695 432 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 BMPR2Q13873 1038 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 PTCHD3Q3KNS1 767 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC15A3Q8IY34 581 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 CAGE1Q8TC20 777 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 PHKBQ93100 1093 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 ALG8Q9BVK2 526 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 STK31Q9BXU1 1019 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 CHST8Q9H2A9 424 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 IL17RBQ9NRM6 502 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 EHD3Q9NZN3 535 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 TLK1Q9UKI8 766 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 CORO2BQ9UQ03 480 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDY1Q9Y6F8 540 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 A1L4Q6 167 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZAR1LA6NP61 321 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 RHPN2P1A8MT19 583 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 H7C4K7 107 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 PMM2O15305 246 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRC1O43663 620 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 TLR5O60602 858 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 CAND2O75155 1236 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 RASSF9O75901 435 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 NUDT3O95989 172 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 TXNP10599 105 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 ITPKBP27987 946 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 PDE6CP51160 858 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 TBX4P57082 545 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 INHBEP58166 350 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 SATB1Q01826 763 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF543Q08ER8 600 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 NPY5RQ15761 445 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 LY6KQ17RY6 165 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 TREML2Q5T2D2 321 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF618Q5T7W0 954 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 DEPDC1Q5TB30 811 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 FCRL6Q6DN72 434 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 KSR2Q6VAB6 950 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 UNC13DQ70J99 1090 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 ABRAQ8N0Z2 381 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 PJA1Q8NG27 643 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM171Q8WVE6 324 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATRIPQ8WXE1 791 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 GLG1Q92896 1179 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 PPP2R3CQ969Q6 453 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZG16BQ96DA0 208 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 PPP1R9BQ96SB3 815 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 DUSP26Q9BV47 211 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 KLK15Q9H2R5 256 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 SERTAD4Q9NUC0 356 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZSCAN32Q9NX65 697 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC17A6Q9P2U8 582 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 C11orf21Q9P2W6 132 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 MID2Q9UJV3 735 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 INSL6Q9Y581 213 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 SNX14Q9Y5W7 946 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 SNX13Q9Y5W8 968 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 KPNA5O15131 536 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCP110O43303 1012 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-227P-201ENST00000362865 RRP9O43818 475 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms