RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 HAUS1Q96CS2 278 aa17.59■□□□□ 0.41
GDE1-201ENST00000353258 GPAMQ9HCL2 828 aa17.59■□□□□ 0.41
GDE1-201ENST00000353258 E5RJQ4 531 aa17.58■□□□□ 0.41
GDE1-201ENST00000353258 K7ENM7 598 aa17.58■□□□□ 0.41
GDE1-201ENST00000353258 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.41
GDE1-201ENST00000353258 TMCO4Q5TGY1 634 aa17.58■□□□□ 0.41
GDE1-201ENST00000353258 FAM91A1Q658Y4 838 aa17.58■□□□□ 0.41
GDE1-201ENST00000353258 LLGL2Q6P1M3 1020 aa17.58■□□□□ 0.41
GDE1-201ENST00000353258 PADI6Q6TGC4 694 aa17.58■□□□□ 0.41
GDE1-201ENST00000353258 FAM172AQ8WUF8 416 aa17.58■□□□□ 0.41
GDE1-201ENST00000353258 TTC17Q96AE7 1141 aa17.58■□□□□ 0.41
GDE1-201ENST00000353258 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.41
GDE1-201ENST00000353258 CATSPER2Q96P56 530 aa17.58■□□□□ 0.41
GDE1-201ENST00000353258 CAPN14A8MX76 684 aa17.58■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 EGFRP00533 1210 aa17.58■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 ASNSP08243 561 aa17.58■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 VCLP18206 1134 aa17.58■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 ABCD1P33897 745 aa17.58■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 ARSEP51690 589 aa17.58■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 GPX6P59796 221 aa17.58■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 GPS1Q13098 491 aa17.58■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 TMEM117Q9H0C3 514 aa17.58■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 EPB41L1Q9H4G0 881 aa17.58■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 PSME4Q14997 1843 aa17.58■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 GOLGA8SH3BPF8 625 aa17.58■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 GOLGA8MH3BSY2 632 aa17.58■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 TXNDC9O14530 226 aa17.58■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 VILLO15195 856 aa17.58■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 ALOX15BO15296 676 aa17.58■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 STK10O94804 968 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP17.58■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 CXCL9Q07325 125 aa17.58■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 MTA1Q13330 715 aa17.58■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 TFDP1Q14186 410 aa17.58■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 NIM1KQ8IY84 436 aa17.58■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 GSTCDQ8NEC7 633 aa17.58■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 PAFAH2Q99487 392 aa17.58■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 PPCSQ9HAB8 311 aa17.58■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 VAMP7P51809 220 aa17.57■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 TMED1Q13445 227 aa17.57■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 ITGA9Q13797 1035 aa17.57■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 PDK3Q15120 406 aa17.57■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 CCDC142Q17RM4 750 aa17.57■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 C2CD6Q53TS8 623 aa17.57■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 ACAD10Q6JQN1 1059 aa17.57■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 RNF111Q6ZNA4 994 aa17.57■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 NDUFA13Q9P0J0 144 aa17.57■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 CCDC160A6NGH7 325 aa17.57■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa17.57■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 FKBP6O75344 327 aa17.57■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 CALCAP01258 141 aa17.57■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 ICAM1P05362 532 aa17.57■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 CD58P19256 250 aa17.57■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 PEX2P28328 305 aa17.57■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 SSTR1P30872 391 aa17.57■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 PTGER2P43116 358 aa17.57■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 MMEL1Q495T6 779 aa17.57■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 B3GNT9Q6UX72 402 aa17.57■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa17.57■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 CENPUQ71F23 418 aa17.57■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa17.57■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 FAM111AQ96PZ2 611 aa17.57■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 USP29Q9HBJ7 922 aa17.57■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 S100A14Q9HCY8 104 aa17.57■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 RABGEF1Q9UJ41 708 aa17.57■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 DNPEPQ9ULA0 475 aa17.57■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 CLUHO75153 1309 aa17.56■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 DCAF8L1A6NGE4 600 aa17.56■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 CHN2P52757 468 aa17.56■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 DNAL1Q4LDG9 190 aa17.56■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 MZB1Q8WU39 189 aa17.56■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 ZNRF3Q9ULT6 936 aa17.56■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 ZNF148Q9UQR1 794 aa17.56■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 ZHX2Q9Y6X8 837 aa17.56■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 LPXNO60711 386 aa17.56■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 SMIM18P0DKX4 95 aa17.56■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 GALK1P51570 392 aa17.56■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 ISLR2Q6UXK2 745 aa17.56■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa17.56■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 CLEC4DQ8WXI8 215 aa17.56■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 SHC3Q92529 594 aa17.56■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 SEL1LQ9UBV2 794 aa17.56■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 UBE4BO95155 1302 aa17.56■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa17.55■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 MEI4A8MW99 385 aa17.55■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 GLRA2P23416 452 aa17.55■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 MXI1P50539 228 aa17.55■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 HSD17B4P51659 736 aa17.55■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 ADARP55265 1226 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
GDE1-201ENST00000353258 MTMR2Q13614 643 aa17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms