RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 MED15Q96RN5 788 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRC-201ENST00000348564 DCLK3Q9C098 648 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 EBF3Q9H4W6 596 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 KCNMB3Q9NPA1 279 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGEF3Q9NR81 526 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRC-201ENST00000348564 TEAD4Q15561 434 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRC-201ENST00000348564 C16orf59Q7L2K0 433 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRC-201ENST00000348564 SLC2A14Q8TDB8 520 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ZFYVE19Q96K21 471 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRC-201ENST00000348564 ITGA11Q9UKX5 1188 aa4.68□□□□□ -1.66
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PTPRC-201ENST00000348564 DOCK1Q14185 1865 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
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PTPRC-201ENST00000348564 MYL1P05976 194 aa4.67□□□□□ -1.66
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PTPRC-201ENST00000348564 TNFSF9P41273 254 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 TKTL1P51854 596 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGEF7Q14155 803 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF235Q14590 738 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 DPCR1Q3MIW9 517 aa4.67□□□□□ -1.66
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PTPRC-201ENST00000348564 TXNDC8Q6A555 127 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 DAAM2Q86T65 1068 aa4.67□□□□□ -1.66
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PTPRC-201ENST00000348564 RAB20Q9NX57 234 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ADAM22Q9P0K1 906 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 PCSK1NQ9UHG2 260 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 MAN1B1Q9UKM7 699 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 MYO6Q9UM54 1294 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 YIPF1Q9Y548 306 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 KAT6AQ92794 2004 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 RGS20O76081 388 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 PSMC3P17980 439 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 COL9A1P20849 921 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CDK7P50613 346 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 DEUP1Q05D60 604 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 STILQ15468 1287 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 EFHC2Q5JST6 749 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SFMBT2Q5VUG0 894 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF720Q7Z2F6 126 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 JAMLQ86YT9 394 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 RNF135Q8IUD6 432 aa4.67□□□□□ -1.66
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PTPRC-201ENST00000348564 ETNPPLQ8TBG4 499 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 C11orf70Q9BRQ4 267 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 PRKD2Q9BZL6 878 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 GULP1Q9UBP9 304 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 CDH7Q9ULB5 785 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 FAM169AQ9Y6X4 670 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 HEPACAM2A8MVW5 462 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-201ENST00000348564 PDXKO00764 312 aa4.67□□□□□ -1.66
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