RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 MAGEA9P43362 315 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 AP2B1P63010 937 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 ORC1Q13415 861 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 NYAP1Q6ZVC0 841 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 REXO1L1PQ8IX06 675 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIML2Q8N7C3 387 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 ACKR2O00590 384 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 MYL2P10916 166 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 CHN1P15882 459 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 ETFBP38117 255 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 ERVK-9P63128 1117 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 SLFN11Q7Z7L1 901 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 MIB1Q86YT6 1006 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 ST13P4Q8IZP2 240 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 KIAA0895Q8NCT3 520 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM198AQ9UFP1 575 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 ANGPT2O15123 496 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 STX7O15400 261 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC27A1Q6PCB7 646 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF410Q86VK4 478 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 ZFPM1Q8IX07 1006 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM172AQ8WUF8 416 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 ADAM33Q9BZ11 813 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 ADCY3O60266 1144 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 PROSCO94903 275 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 AXLP30530 894 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 BST2Q10589 180 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 SH2D3CQ8N5H7 860 aa16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 CYTH3O43739 400 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 PRUNE1Q86TP1 453 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 TLK2Q86UE8 772 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP16.98■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 NAT9Q9BTE0 207 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 ING2Q9H160 280 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 RRAGCQ9HB90 399 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 INTS13Q9NVM9 706 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP16.98■□□□□ 0.312e-6■■■□□ 14.6
SH3BP4-201ENST00000344528 CKMP06732 381 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 PPIL2Q13356 520 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 IQSEC1Q6DN90 963 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKS3Q6ZW76 656 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 NT5DC4Q86YG4 428 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 YME1L1Q96TA2 773 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 TRIM4Q9C037 500 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 ECT2Q9H8V3 914 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 PMPCBO75439 489 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 CUL3Q13618 768 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 TFR2Q9UP52 801 aa16.98■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 CNTN2Q02246 1040 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 ABRAQ8N0Z2 381 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 EPN3Q9H201 632 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 ALDH2P05091 517 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 GCNT1Q02742 428 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 RGS9BPQ6ZS82 235 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 EXD1Q8NHP7 514 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 SUPT3HO75486 399 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 MFSD10Q14728 455 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAJB3Q8WWF6 145 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 GPRC5DQ9NZD1 345 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 MYO1CO00159 1063 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 SOX10P56693 466 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 VGLL4Q14135 290 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC6Q86X45 466 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 RIOX2Q8IUF8 465 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 YY1AP1Q9H869 796 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 AK9Q5TCS8 1911 aa16.97■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 NT5DC1Q5TFE4 455 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 BRSK2Q8IWQ3 736 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 UCMAQ8WVF2 138 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 SNTG2Q9NY99 539 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 CRLS1Q9UJA2 301 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 INHBEP58166 350 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 ACVR2BQ13705 512 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC29A2Q14542 456 aa16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms