RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 LIN54Q6MZP7 749 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 DCUN1D1Q96GG9 259 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 MYO9BQ13459 2157 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF185O15231 689 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 ACAT1P24752 427 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
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PKHD1-201ENST00000340994 DNAJC3Q13217 504 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 NAB1Q13506 487 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 C7orf31Q8N865 590 aa8.53□□□□□ -1.04
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PKHD1-201ENST00000340994 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
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PKHD1-201ENST00000340994 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
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PKHD1-201ENST00000340994 CHD4Q14839 1912 aa8.53□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 ADCY6O43306 1168 aa8.52□□□□□ -1.04
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PKHD1-201ENST00000340994 ZNF846Q147U1 533 aa8.52□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 SGMS1Q86VZ5 419 aa8.52□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 RNF135Q8IUD6 432 aa8.52□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 TC2NQ8N9U0 490 aa8.52□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 A0A1W2PRG6 482 aa8.52□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 UBE2QL1A1L167 161 aa8.52□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 EFNA5P52803 228 aa8.52□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 MINDY2Q8NBR6 621 aa8.52□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 MS4A14Q96JA4 679 aa8.52□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 MKNK1Q9BUB5 465 aa8.52□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 RAB21Q9UL25 225 aa8.52□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 L1RE1Q9UN81 338 aa8.52□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 LEMD3Q9Y2U8 911 aa8.52□□□□□ -1.04
PKHD1-201ENST00000340994 EFCAB10A6NFE3 127 aa8.52□□□□□ -1.05
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PKHD1-201ENST00000340994 WEE2P0C1S8 567 aa8.52□□□□□ -1.05
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PKHD1-201ENST00000340994 PRIM2P49643 509 aa8.52□□□□□ -1.05
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PKHD1-201ENST00000340994 DUOXA2Q1HG44 320 aa8.52□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 PADI6Q6TGC4 694 aa8.52□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 TEX13BQ9BXU2 312 aa8.52□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 POTEMA6NI47 508 aa8.52□□□□□ -1.05
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PKHD1-201ENST00000340994 PRKAR1AP10644 381 aa8.52□□□□□ -1.05
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PKHD1-201ENST00000340994 POTEGQ6S5H5 508 aa8.52□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 C18orf8Q96DM3 657 aa8.52□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF560Q96MR9 790 aa8.52□□□□□ -1.05
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PKHD1-201ENST00000340994 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 LSM1O15116 133 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 GYPCP04921 128 aa8.52□□□□□ -1.05
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PKHD1-201ENST00000340994 MAPK6Q16659 721 aa8.52□□□□□ -1.05
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PKHD1-201ENST00000340994 GPD1LQ8N335 351 aa8.52□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 CAPSLQ8WWF8 208 aa8.52□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 KCND1Q9NSA2 647 aa8.52□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 SHOC2Q9UQ13 582 aa8.52□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 TRAPPC3O43617 180 aa8.52□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF12P17014 697 aa8.52□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 FMO5P49326 533 aa8.52□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 TCP10Q12799 353 aa8.52□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 SH3KBP1Q96B97 665 aa8.52□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 ELMO2Q96JJ3 720 aa8.52□□□□□ -1.05
PKHD1-201ENST00000340994 NDFIP2Q9NV92 336 aa8.52□□□□□ -1.05
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