RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 H7C4K7 107 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 SEC16BQ96JE7 1060 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 POLLQ9UGP5 575 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 B2RBV5 119 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 P4HA2O15460 535 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 CYP11B2P19099 503 aa23.23■■□□□ 1.31
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PTPRM-201ENST00000332175 ATG4AQ8WYN0 398 aa23.23■■□□□ 1.31
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PTPRM-201ENST00000332175 TUBE1Q9UJT0 475 aa23.23■■□□□ 1.31
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF286BP0CG31 522 aa23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 LINC00523Q86TU6 105 aa23.23■■□□□ 1.31
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PTPRM-201ENST00000332175 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 HPS5Q9UPZ3 1129 aa23.22■■□□□ 1.31
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PTPRM-201ENST00000332175 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa23.22■■□□□ 1.31
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PTPRM-201ENST00000332175 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
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PTPRM-201ENST00000332175 WEE1P30291 646 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 NME5P56597 212 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 CDC16Q13042 620 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
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PTPRM-201ENST00000332175 ERAP2Q6P179 960 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.22■■□□□ 1.31
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PTPRM-201ENST00000332175 C10orf53Q8N6V4 93 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 SGSM3Q96HU1 749 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 KCNK16Q96T55 309 aa23.22■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
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PTPRM-201ENST00000332175 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC29A2Q14542 456 aa23.21■■□□□ 1.31
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PTPRM-201ENST00000332175 APOA1P02647 267 aa23.21■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 KRT16P08779 473 aa23.21■■□□□ 1.31
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PTPRM-201ENST00000332175 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.31
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PTPRM-201ENST00000332175 DEFB128Q7Z7B8 93 aa23.2■■□□□ 1.31
PTPRM-201ENST00000332175 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 SLC15A2Q16348 729 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 FAM83EQ2M2I3 478 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 YME1L1Q96TA2 773 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 CASTOR2A6NHX0 329 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP23.2■■□□□ 1.31e-6■■□□□ 13.9
PTPRM-201ENST00000332175 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM132BQ14DG7 1078 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 ANKS1AQ92625 1134 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 OGTO15294 1046 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 MTSS1O43312 755 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 SOX10P56693 466 aa23.2■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
PTPRM-201ENST00000332175 KCNB2Q92953 911 aa23.2■■□□□ 1.3
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