RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325558.10

PGA3-201, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGA3, Length 1,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-201ENST00000325558 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa11.91□□□□□ -0.5
PGA3-201ENST00000325558 SNX9Q9Y5X1 595 aa11.91□□□□□ -0.5
PGA3-201ENST00000325558 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PGA3-201ENST00000325558 RIPK2O43353 540 aa11.9□□□□□ -0.5
PGA3-201ENST00000325558 GAS8O95995 478 aa11.9□□□□□ -0.5
PGA3-201ENST00000325558 KRT1P04264 644 aa11.9□□□□□ -0.5
PGA3-201ENST00000325558 ITGAVP06756 1048 aa11.9□□□□□ -0.5
PGA3-201ENST00000325558 KRT7P08729 469 aa11.9□□□□□ -0.5
PGA3-201ENST00000325558 CETN2P41208 172 aa11.9□□□□□ -0.5
PGA3-201ENST00000325558 SLC29A2Q14542 456 aa11.9□□□□□ -0.5
PGA3-201ENST00000325558 PPP1R7Q15435 360 aa11.9□□□□□ -0.5
PGA3-201ENST00000325558 KCTD16Q68DU8 428 aa11.9□□□□□ -0.5
PGA3-201ENST00000325558 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PGA3-201ENST00000325558 OLFML1Q6UWY5 402 aa11.9□□□□□ -0.5
PGA3-201ENST00000325558 ARCQ7LC44 396 aa11.9□□□□□ -0.5
PGA3-201ENST00000325558 SESTD1Q86VW0 696 aa11.9□□□□□ -0.5
PGA3-201ENST00000325558 CCDC50Q8IVM0 306 aa11.9□□□□□ -0.5
PGA3-201ENST00000325558 ALLCQ8N6M5 410 aa11.9□□□□□ -0.5
PGA3-201ENST00000325558 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
PGA3-201ENST00000325558 PEBP4Q96S96 227 aa11.9□□□□□ -0.5
PGA3-201ENST00000325558 CNPY3Q9BT09 278 aa11.9□□□□□ -0.5
PGA3-201ENST00000325558 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PGA3-201ENST00000325558 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
PGA3-201ENST00000325558 CYLDQ9NQC7 956 aa11.9□□□□□ -0.5
PGA3-201ENST00000325558 KLHL11Q9NVR0 708 aa11.9□□□□□ -0.5
PGA3-201ENST00000325558 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa11.9□□□□□ -0.5
PGA3-201ENST00000325558 DNPEPQ9ULA0 475 aa11.9□□□□□ -0.5
PGA3-201ENST00000325558 GINS2Q9Y248 185 aa11.9□□□□□ -0.5
PGA3-201ENST00000325558 IPPQ9Y573 584 aa11.9□□□□□ -0.5
PGA3-201ENST00000325558 KPNA7A9QM74 516 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 E5RJQ4 531 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 TULP2O00295 520 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 PTGESO14684 152 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 ADAMTS4O75173 837 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 MYZAPP0CAP1 466 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 MIPP30301 263 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 CHKAP35790 457 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 SCNN1AP37088 669 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 ITGA8P53708 1063 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 VCPP55072 806 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 CAP1Q01518 475 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 LMNB2Q03252 620 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 MGAT3Q09327 533 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 SREBF2Q12772 1141 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 CBLBQ13191 982 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 DPH6Q7L8W6 267 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 ACOT1Q86TX2 421 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 CCDC89Q8N998 374 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 GLIS1Q8NBF1 620 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 TRIB2Q92519 343 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 WNT8BQ93098 351 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 TRAIPQ9BWF2 469 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 FOXP3Q9BZS1 431 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 MIS12Q9H081 205 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 TSPYL1Q9H0U9 437 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 GABRQQ9UN88 632 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 TCEA3O75764 348 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 NR1D1P20393 614 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 PNPLA4P41247 253 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 CALCOCO2Q13137 446 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 CCDC14Q49A88 953 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 GLRA4Q5JXX5 417 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 FBXO47Q5MNV8 452 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 SERINC5Q86VE9 423 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 VSIG1Q86XK7 387 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 C7orf31Q8N865 590 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 ANKRD52Q8NB46 1076 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 BBOF1Q8ND07 529 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 KLHDC9Q8NEP7 349 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 RXFP2Q8WXD0 754 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 CAPS2Q9BXY5 557 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 USP18Q9UMW8 372 aa11.89□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 GABRDO14764 452 aa11.88□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP11.88□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 CHRNA1P02708 482 aa11.88□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 CD48P09326 243 aa11.88□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 GPD1P21695 349 aa11.88□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 WARSP23381 471 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 IL4RP24394 825 aa11.88□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 LMO2P25791 158 aa11.88□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 SSR1P43307 286 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 LILRA4P59901 499 aa11.88□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 SLC6A3Q01959 620 aa11.88□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 PDE4CQ08493 712 aa11.88□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 TAF5Q15542 800 aa11.88□□□□□ -0.51
PGA3-201ENST00000325558 HADHQ16836 314 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.2 ms