RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 RDH13Q8NBN7 331 aa20.99■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 MYLPFQ96A32 169 aa20.99■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 MMS19Q96T76 1030 aa20.99■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 CRTAC1Q9NQ79 661 aa20.99■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 SEMA4GQ9NTN9 838 aa20.99■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 TGFB1I1O43294 461 aa20.98■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 ATG13O75143 517 aa20.98■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 YEATS4O95619 227 aa20.98■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 EGFP01133 1207 aa20.98■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 PDGFRBP09619 1106 aa20.98■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 WARSP23381 471 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 GALK1P51570 392 aa20.98■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF77Q15935 545 aa20.98■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.98■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa20.98■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 CPA6Q8N4T0 437 aa20.98■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 RTKNQ9BST9 563 aa20.98■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa20.98■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 C2orf78A6NCI8 922 aa20.97■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 CLIC2O15247 247 aa20.97■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 RNF40O75150 1001 aa20.97■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 DLATP10515 647 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 TNNI1P19237 187 aa20.97■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 BDNFP23560 247 aa20.97■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 GJA4P35212 333 aa20.97■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 GRIK1P39086 918 aa20.97■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 PXNP49023 591 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 CYP27A1Q02318 531 aa20.97■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 USP4Q13107 963 aa20.97■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 VSTM1Q6UX27 236 aa20.97■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 NELFCDQ8IXH7 590 aa20.97■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 OSCP1Q8WVF1 389 aa20.97■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 SPATA17Q96L03 361 aa20.97■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 P2RY13Q9BPV8 354 aa20.97■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 C7orf25Q9BPX7 421 aa20.97■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 ECT2Q9H8V3 914 aa20.97■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 GCNT4Q9P109 453 aa20.97■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 SLC8A2Q9UPR5 921 aa20.97■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 WNT6Q9Y6F9 365 aa20.97■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 GREB1Q4ZG55 1949 aa20.96■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa20.96■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 DCDC2BA2VCK2 349 aa20.96■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 CST3P01034 146 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 DRD1P21728 446 aa20.96■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 IFNAR2P48551 515 aa20.96■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 CYP2J2P51589 502 aa20.96■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 KCNB1Q14721 858 aa20.96■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 CSRP2Q16527 193 aa20.96■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 SH3RF2Q8TEC5 729 aa20.96■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 EXOC4Q96A65 974 aa20.96■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC127Q96BQ5 260 aa20.96■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 PCED1BQ96HM7 432 aa20.96■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 FNBP1Q96RU3 617 aa20.96■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 CGRRF1Q99675 332 aa20.96■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
CXCL3-201ENST00000296026 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 HDCP19113 662 aa20.95■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 ANXA13P27216 316 aa20.95■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 CASP1P29466 404 aa20.95■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 USP46P62068 366 aa20.95■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 CYP24A1Q07973 514 aa20.95■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 PSMD6Q15008 389 aa20.95■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 EML3Q32P44 896 aa20.95■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 PRR23CQ6ZRP0 262 aa20.95■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa20.95■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 UNC13DQ70J99 1090 aa20.95■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 XXYLT1Q8NBI6 393 aa20.95■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa20.95■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 NETO1Q8TDF5 533 aa20.95■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 SCFD1Q8WVM8 642 aa20.95■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 GAB3Q8WWW8 586 aa20.95■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 ATP2A3Q93084 1043 aa20.95■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 CEP295NLQ96MC4 621 aa20.95■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.95■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 SNX25Q9H3E2 840 aa20.95■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 MAGEF1Q9HAY2 307 aa20.95■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 UBE4BO95155 1302 aa20.95■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa20.94■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 EHHADHQ08426 723 aa20.94■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 WDR72Q3MJ13 1102 aa20.94■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 FBXO43Q4G163 708 aa20.94■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 MDH1BQ5I0G3 518 aa20.94■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.94■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 OR6B3Q8NGW1 331 aa20.94■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 CD101Q93033 1021 aa20.94■□□□□ 0.94
CXCL3-201ENST00000296026 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1003.6 ms