RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271688.10

CERS2-201, Transcript of ceramide synthase 2, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CERS2, Length 2,544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CERS2-201	ENST00000271688	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	TAC1	P20366	129 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	MIP	P30301	263 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	GPX6	P59796	221 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	CXorf38	Q8TB03	319 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	CPT1B	Q92523	772 aa		28.88	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	CILP	O75339	1184 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	VTN	P04004	478 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	28.87	■■■□□ 2.21	1e-6	■■■■□ 23.8
CERS2-201	ENST00000271688	BBS12	Q6ZW61	710 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	RFX6	Q8HWS3	928 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	SSTR1	P30872	391 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	HIF1A	Q16665	826 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	SPOCK2	Q92563	424 aa		28.87	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688		A0A1W2PPM1	405 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	CALN1	Q9BXU9	219 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	MMRN1	Q13201	1228 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	AMHR2	Q16671	573 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	FNIP1	Q8TF40	1166 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	AKT3	Q9Y243	479 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	CLUH	O75153	1309 aa		28.86	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	GSTA1	P08263	222 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	SLC26A2	P50443	739 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	TTLL4	Q14679	1199 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	PNMA3	Q9UL41	463 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	28.85	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	GPD2	P43304	727 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	NPNT	Q6UXI9	565 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	FAM228A	Q86W67	206 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	CCDC63	Q8NA47	563 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	PEBP4	Q96S96	227 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	USP18	Q9UMW8	372 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	ARL2BP	Q9Y2Y0	163 aa		28.85	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	PHKA2	P46019	1235 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	IL9R	Q01113	521 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	MGAT5	Q09328	741 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	MOGS	Q13724	837 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	SYCP2L	Q5T4T6	812 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	TDRP	Q86YL5	185 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	HPDL	Q96IR7	371 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	CXCL11	O14625	94 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	GRAP2	O75791	330 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	ASMTL	O95671	621 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	TAZ	Q16635	292 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	FITM2	Q8N6M3	262 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		28.84	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	DNAJC3	Q13217	504 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	TMEM63A	O94886	807 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	ZNF286B	P0CG31	522 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	CYP3A5	P20815	502 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	SNCB	Q16143	134 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	TRNP1	Q6NT89	227 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	ILDR2	Q71H61	639 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CERS2-201	ENST00000271688	RNF8	O76064	485 aa		28.82	■■■□□ 2.2
CERS2-201	ENST00000271688	LGALS2	P05162	132 aa		28.82	■■■□□ 2.2
CERS2-201	ENST00000271688	ARHGAP1	Q07960	439 aa		28.82	■■■□□ 2.2
CERS2-201	ENST00000271688	MTFR1	Q15390	333 aa		28.82	■■■□□ 2.2

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